Loading article…
MDGRAPE-3は、日本の理化学研究所が開発した超高性能ペタスケール スーパーコンピュータシステムです。分子動力学シミュレーション、特にタンパク質構造予測のために構築された専用システムです。[1]
MDGRAPE-3 は、24 個のカスタム MDGRAPE-3 チップ (合計 4,824 個) の 201 ユニットと、ホスト マシンとして機能する 追加のデュアル コア Intel Xeonプロセッサ (コード名「Dempsey」 ) で構成されています。
2006年6月、理化学研究所は完成を発表し、[2]ペタFLOPSレベルの浮動小数点演算性能を達成した。 [2]これは、当時スーパーコンピュータTOP500リストで0.28ペタFLOPSでトップだったIBM Blue Gene/Lシステムの2006年バージョンよりも3倍以上高速だった。MDGRAPE-3はLINPACKベンチマークを実行できる汎用マシンではないため、TOP500リストの資格を満たしていない。
参照
参考文献
- ^ ケアリー、ビョルン（2006）、「私たちが愛するオーバーアチーバーズ - より速く」、ポピュラーサイエンス、269（6）：24
- ^ ab 理化学研究所プレスリリース、分子動力学シミュレーション用1ペタフロップスコンピュータシステムの完成
- 泰地誠、「MDGRAPE-3チップ：分子動力学シミュレーション用165ギガフロップスアプリケーション専用LSI」、第16回IEEEホットチップシンポジウム、2004年8月。[1]
外部リンク
- MD-GRAPE プロジェクト@IBM
- 理化学研究所 高性能分子シミュレーションチーム
- ペタコンピューティング研究所
- 鳴海哲のMDGRAPEページ
- MDGRAPE-2を用いた分子動力学計算装置