張 洛欣

張洛鑫はカナダの計算生物学者です。現在はシンガポール国立大学数学科の教授です。^{[1]数学における組合せ}半群論への貢献が認められています。さらに、系統樹とネットワークの数学的理解に関する研究や、バイオインフォマティクスにおける配列比較のための間隔シードの分析でも知られています。^[2]

張洛鑫は中国河南省洛陽市で育ち、蘭州大学で数学の学士号と修士号を取得しました。その後、カナダのウォータールー大学でコンピュータサイエンスの博士号を取得し、「ツリーのメッシュとクリークのハイパーキューブのエミュレーションと埋め込み」と題した論文でコンピュータサイエンスの博士号を取得しました。^{[1] [3] [4]}

ミン・リーの研究室で博士研究員として研究を行った後、張氏は1996年にシステム科学研究所（現情報通信研究所）で独立した研究を開始し、1997年に3年間のリー・クアンユー博士研究員を受賞した。^[5]彼は、特殊モノイドの単語問題と共役問題を調査するために文字列書き換え技術を導入した。^{[6] [7] [8]彼は、}遺伝子損失、遺伝子重複、および不完全な系統分類コストの間に優雅な関係を発見した。彼は同僚とともに、系統ネットワークを研究するためのツリーコンポーネント分解法を開発した。^[9]この技術は、ツリーの包含、いわゆるツリーチャイルドネットワークの正確で漸近的なカウント、および最小系統を推測するためのスケーラブルな方法に関する未解決の問題に対する解決策を生み出す。彼はまた、祖先ゲノム配列の配列比較と再構築のための間隔シードの理論的知識にも貢献した。^[10]

• Zhang L. 1991. 特殊モノイドの共役性。代数ジャーナル 143: 487-497。
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• Choi KP、Zeng F、Zhang L. 相同性検索に適した間隔の広いシード。バイオインフォマティクス 20:1053-1059。
• Li, Guoliang; Steel, Mike; Zhang, Louxin (2008-08-01). 「祖先の特徴状態の再構築には、分類群の数が多いほど良いとは限らない」。 系統生物学。57 (4): 647–653。arXiv : 0803.0195。doi : 10.1080 /  10635150802203898。ISSN 1063-5157。PMID 18709600。S2CID 1373201  。
• Zhang, Louxin (2011 年 11 月)。「遺伝子ツリーから種ツリーへII : ディープ コアレッセンス イベントの最小化による種ツリーの推論」。IEEE /  ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics。8 ( 6): 1685–1691。doi : 10.1109 /TCBB.2011.83。ISSN 1557-9964。PMID 21576759。S2CID  226872  。
• Tran, Ngoc Hieu; Choi, Kwok Pui; Zhang, Louxin (2013-08-06). 「ヒトインタラクトームにおけるモチーフのカウント」. Nature Communications . 4 (1): 2241. Bibcode :2013NatCo...4.2241T. doi :10.1038/ncomms3241. ISSN  2041-1723. PMC 3741638.  PMID 23917172  .
• Gambette, Philippe; Gunawan, Andreas DM; Labarre, Anthony; Vialette, Stéphane; Zhang, Louxin (2015). 「系統ネットワーク内のツリーを2次時間で特定する」。計算分子生物学の研究。コンピュータサイエンスの講義ノート。第9029巻。pp. 96–107。arXiv : 1502.03379。doi : 10.1007 /978-3-319-16706-0_12。ISBN 978-3-319-16705-3. S2CID  8258359。
• Zheng, Yu; Zhang, Louxin (2017-08-17). 「非バイナリ遺伝子ツリーとの調和の再考」Journal of the ACM . 64 (4): 24:1–24:28. doi :10.1145/3088512. ISSN  0004-5411. S2CID  7715566.
• Gunawan, Andreas DM; DasGupta, Bhaskar; Zhang, Louxin (2017-02-01). 「網目構造が見えるネットワークのための分解定理と 2 つのアルゴリズム」. Information and Computation . 252 : 161–175. doi : 10.1016/j.ic.2016.11.001 . ISSN  0890-5401.
• Zhang, Louxin; Abhari, Niloufar; Colijn, Caroline; Wu, Yufeng ( 2023-01-03 ). 「系統分類群文字列を整列させることにより、ツリーから系統ネットワークを推測する高速でスケーラブルな方法」。arXiv : 2301.00992 [q-bio.PE]。