ライブベンチ

LiveBench は、タンパク質構造予測と二次構造予測法の品質を評価するための継続的に実行されるベンチマークプロジェクトです。LiveBench は主に相同性モデリングとタンパク質スレッドに焦点を当てていますが、二次構造予測も含まれており、公開されているWeb サーバーの出力をProtein Data Bankに新しく登録されたタンパク質構造と比較します。EVAプロジェクトと同様ですが、関連するCASPおよびCAFASP実験とは異なり、LiveBench は、公開されている予測法の専門家ではないユーザーが得る予測の精度を調査することを目的としています。2 年に 1 回実行される CASP プロジェクトに対する LiveBench と EVA の主な利点は、比較的大規模なデータ セットです。

• Bujnicki JM、Elofsson A、Fischer D、Rychlewski L. (2001)。LiveBench-1: タンパク質構造予測サーバーの継続的なベンチマーク。Protein Sci 10 (2):352-61。PMID  11266621
• Rychlewski L、Fischer D. (2005)。LiveBench-8: 自動化されたタンパク質構造予測の大規模かつ継続的な評価。Protein Sci 14 (1):240-5。PMID  15608124

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