EVA（ベンチマーク）

EVA は、タンパク質構造予測と二次構造予測方法の品質と価値を評価するための継続的に実行されているベンチマークプロジェクトでした。二次構造と三次構造の両方を予測する方法(相同性モデリング、タンパク質スレッディング、接触順序予測など) が、タンパク質データバンクに保管されている毎週新たに解明されたタンパク質構造の結果と比較されました。このプロジェクトの目的は、一般的な公開予測Web サーバーの非専門家ユーザーに期待される予測精度を決定することでした。これは、関連するLiveBenchプロジェクトに似ており、予測の専門家が達成できる最大精度を特定することを目的とする 2 年ごとのベンチマークCASPとは対照的です。

• Rost B、Eyrich VA. (2001 ) 。EVA  :二次構造予測の大規模解析。Proteins Suppl 5:192-9。PMID 11835497
• Eyrich VA、Marti-Renom MA、Przybylski D、Madhusudhan MS、Fiser A、Pazos F、Valencia A、Sali A、Rost B. (2001)。EVA: タンパク質構造予測サーバーの連続自動評価。バイオインフォマティクス17(12):  1242-3。PMID 11751240
• Koh IY、Eyrich VA、Marti-Renom MA、Przybylski D、Madhusudhan MS、Eswar N、Grana O、Pazos F、Valencia A、Sali A、Rost B. (2003)。EVA: タンパク質構造予測サーバーの評価。Nucleic Acids Res 31(13):3311-5。PMID  12824315

• EVAメインサイト