LCPファミリー

ポリイソプレニル-テイコ酸-ペプチドグリカンテイコ酸トランスフェラーゼ TagU
ポリイソプレニル-テイコ酸-ペプチドグリカンテイコ酸トランスフェラーゼ TagU
識別子
シンボル	タグU
インタープロ	IPR023734
	同じファミリーを記述します。これは全長タンパク質です

利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要

細胞膜関連転写減衰ドメイン（TagU触媒ドメイン）
細胞膜関連転写減衰ドメイン（TagU触媒ドメイン）
識別子
シンボル	翻訳:
パム	PF03816
インタープロ	著作権
キャス	3tflA02
パム
利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
	UniProtファミリー

LytR/CpsA/Psr、C末端ドメイン

識別子

シンボル

翻訳者

パム

PF13399

インタープロ

著作権

利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要

LCPファミリーまたはTagUファミリーのタンパク質は、テイコ酸（TA）分子をグラム陽性細胞壁または細胞膜に付着させるのに関与するホスホトランスフェラーゼの保存されたファミリーです。当初はオートリシンをコードするLytABCオペロンのLytR（溶解抑制因子）成分であると考えられていましたが^[1]、後に制御のメカニズムはTA分子の生成であることが判明しました。それに応じてTagUに改名されました。^[2]

「LCP」という頭字語は、このドメインを含むことが最初に特定された3つのタンパク質、LytR（現在はTagU、Q02115）、cpsA（「莢膜多糖発現調節因子」）、psr（「PBP 5合成抑制因子」）に由来しています。これらのタンパク質は、さまざまな理由から転写調節因子と誤解されていましたが、現在では3つともTagU様酵素であることがわかっています。^[3]^[4] TagU自体はTA分子をペプチドグリカン細胞壁に結合させる（WTAを形成）だけですが、他のLCPタンパク質は細胞壁タンパク質をグリコシル化（A. oris LcpA、PDB：5V8C）^[5]したり、TA分子を細胞膜アンカーに結合（LTAを形成）したりします。^[6] すべてではないにしても、ほとんどのLCPタンパク質は二次ピロホスファターゼ活性も持っています。^[7]

典型的なTagUタンパク質は、N末端膜貫通ドメイン（アンカー用）、オプションの非保存アクセサリドメイン（CATH 3tflA01）、コア触媒ドメイン、および場合によっては構造が不明なC末端ドメインで構成されています。コアLCPドメインはマグネシウム依存性酵素です。^[2]

参考文献

^ Lazarevic V、Margot P、Soldo B、Karamata D (1992 年 9 月)。「枯草菌 lytRABC divergon の配列と分析: N-アセチルムラモイル-L-アラニンアミダーゼとその修飾因子の構造遺伝子を含む調節ユニット」。Journal of General Microbiology。138 ( 9): 1949–61。doi : 10.1099 /00221287-138-9-1949。PMID 1357079。
^ ab Kawai Y, Marles-Wright J, Cleverley RM, Emmins R, Ishikawa S, Kuwano M, et al. (2011年9月). 「細菌細胞壁アセンブリタンパク質の広範なファミリー」. The EMBO Journal . 30 (24): 4931–41. doi :10.1038/emboj.2011.358. PMC 3243631. PMID 21964069 .
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外部リンク

MetaCyc RXN-18030: ポリイソプレニル-テイコ酸-ペプチドグリカンテイコ酸トランスフェラーゼ

[1] Lazarevic V、Margot P、Soldo B、Karamata D (1992 年 9 月)。「枯草菌 lytRABC divergon の配列と分析: N-アセチルムラモイル-L-アラニンアミダーゼとその修飾因子の構造遺伝子を含む調節ユニット」。Journal of General Microbiology。138 ( 9): 1949–61。doi : 10.1099 /00221287-138-9-1949。PMID 1357079。

[pmid21964069-2] Kawai Y, Marles-Wright J, Cleverley RM, Emmins R, Ishikawa S, Kuwano M, et al. (2011年9月). 「細菌細胞壁アセンブリタンパク質の広範なファミリー」. The EMBO Journal . 30 (24): 4931–41. doi :10.1038/emboj.2011.358. PMC 3243631. PMID 21964069 .

[3] Wang Q, Zhu L, Jones V, Wang C, Hua Y, Shi X, et al. (2015年7月). 「Mycobacterium marinumのLytR-CpsA-Psrファミリータンパク質であるCpsAは、細胞壁の完全性と毒性に必要である」.感染と免疫. 83 (7): 2844–54. doi : 10.1128/IAI.03081-14 . PMC 4468561. PMID 25939506 .

[4] Maréchal M、Amoroso A、Morlot C、Vernet T、Coyette J、Joris B (2016 年 10 月)。「Enterococcus hirae LcpA (Psr)、分裂部位に局在する新しいペプチドグリカン結合タンパク質」。BMC Microbiology。16 ( 1 ) : 239。doi : 10.1186 /s12866-016-0844- y。PMC 5059904。PMID 27729019。

[5] ^ Amer BR、Clubb RT （2014年12月）。「タンパク質グリコシル化におけるLCP酵素の新たな役割」。分子微生物学。94 （6）：1197–200。doi ：10.1111/ mmi.12825。PMC 4262582。PMID 25302626。

[pmid24819367-6] ^ Percy MG、Gründling A (2014年9月 8日)。「グラム陽性細菌におけるリポテイコ酸の合成と機能」。Annual Review of Microbiology。68 (1): 81–100。doi : 10.1146 /annurev-micro-091213-112949。PMID 24819367。

[7] Siegel SD、Amer BR、Wu C、Sawaya MR、Gosschalk JE、Clubb RT、Ton-That H（2019年2月）。「グラム陽性細菌の細胞壁アンカータンパク質のグリコシル化を仲介するホスホトランスフェラーゼLcpAの構造とメカニズム」。mBio。10 （ 1 ）。doi ： 10.1128 / mBio.01580-18。PMC 6381275。PMID 30782654。