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1933年、東魯大学は医学専門課程を開設し、これが現在の昆明医科大学（KMU）の医学教育の起源となりました。1937年、課程の発展に伴い、医学部が設立され、旧東魯大学である雲南大学に所属することになりました。1956年、医学部は独立した医科大学となり、昆明医科大学と改称されました。1993年には、雲南省の重点高等教育機関の一つに指定されました。2012年、中国教育部の評価を経て、大学レベルに昇格し、昆明医科大学と改称されました。現在、昆明医科大学は雲南省最大の専門医科大学となっています。
大学のキャンパス面積は125.4ヘクタール（310エーカー）です。学生数は約1万5000人で、そのうち1400人以上が大学院生です。大学には6000人の職員がおり、そのうち1150人以上が教授または准教授です。
KMUには13の学部があり、学士課程15、修士課程34、博士課程1を提供しています。また、5つの研究機関、9つの付属病院、9つの教育病院、39の臨床病院、9つの法医学施設、6つの予防医学臨床施設、4つの薬学臨床施設、2つの眼科臨床施設を有しています。これらすべてが、KMUの学生に安定した学習・臨床環境を提供しています。
約10万冊の蔵書を誇る同大学図書館は、雲南省の国家文学中央共有図書館ネットワークに指定されている。また、中国の医学・学術文献の一級保管所でもある。KMUは、国家臨床医学試験センターおよび雲南省専門家証言センターでもある。
昆明医科大学の9つの付属病院には、9,800床以上の病床があります。付属病院のうち7つは、中国のA級三次総合病院として認定されています。第一付属病院は、1日あたり3,000人以上の外来患者を受け入れており、省内最大の総合病院です。昆明医科大学の第二付属病院は、「中国の総合病院100選」に選ばれており、雲南省における臓器移植と火傷治療の中心となっています。第三付属病院は、省内最大のがん専門病院であり、3つの省がん研究センターを擁しています。付属口腔病院には100台以上の歯科用チェアがあり、最先端の技術を使用しています。雲南省最大の口腔専門病院です。
雲南省は豊富な天然資源を誇り、KMUは雲南省でよく見られる風土病や頻繁に発生する病気について広範な科学研究を行い、診断と治療に常に最先端技術を活用しています。KMUは、基礎研究、応用研究、開発研究など、複数の分野と専門分野にわたる科学研究の様々な段階に関わっています。KMUは、多数の国および省レベルの重点科学プロジェクトや国際協力プログラムを担当しています。2004年以降、800件以上の科学研究が国および省レベルで賞を受賞しており、国家発明賞、国家科学技術会議賞など、数多くの賞を獲得しています。KMUは、省の医療と健康分野におけるリーダーです。
昆明医科大学は、国際交流と協力の分野で目覚ましい成果を上げています。米国、英国、インド、フランス、スウェーデン、イタリア、ドイツ、オーストラリア、日本、タイ、ベトナムなど、世界各国の100以上の医科大学や研究機関と、機関間学術提携や交流プログラムを展開しています。また、60名以上の外国人研究者に名誉教授や客員教授の称号を授与しています。
KMUは15分野で学士課程を提供しています。
KMUは34分野で修士課程（3年間）を提供しています。
KMUは博士課程（3年間）も1つ提供しています。