HBV RNAカプセル化シグナルε（HBV_ε ）は、 HBVウイルスの複製に不可欠な要素である。
これは、HBVプレゲノムRNAの5'末端付近に位置するRNA構造です。[ 1 ] この構造は、下部ステム、バルジ領域、上部ステム、およびトリループから構成されています。この構造は、酵素プロービングとNMR分光法によって決定され、精密化されました。[ 2 ] トリループの閉鎖はRNA構造予測プログラムでは予測されませんでしたが、NMR構造で観察されました。ウイルスライフサイクルにおけるRNAのカプセル化に重要な領域は、HBVウイルスRNAポリメラーゼの末端タンパク質ドメインと相互作用するバルジ、上部ステム、およびトリループです。[ 3 ] [ 4 ]
参考文献
- ↑ Beck J、Nassal M（2007年1月）。 「B型肝炎ウイルスの複製」。World J. Gastroenterol。13（1）：48–64。doi：10.3748 / wjg.v13.i1.48。PMC 4065876。PMID 17206754。
- ↑ Flodell S、Schleucher J、Cromsigt J、Ippel H、Kidd-Ljunggren K、Wijmenga S (2002年11月)。「 B型肝炎ウイルスのカプセル化シグナルの頂端ステムループは、2つの基底ピリミジンバルジを持つ安定なトリループに折り畳まれる」。Nucleic Acids Res。30 ( 21 ): 4803–4811。doi : 10.1093/nar / gkf603。PMC 135823。PMID 12409471。
- ↑ Kramvis A、Kew MC (1998 年 11 月)。「ヘパドナウイルス科のカプセル化シグナルの構造と機能」。J . Viral Hepat . 5 (6): 357–367 . doi : 10.1046/j.1365-2893.1998.00124.x . PMID 9857345. S2CID 6726175 .
- ↑ Beck, J; Nassal, M (2003). "アヒルB型肝炎ウイルス逆転写酵素（Hsp90クライアントタンパク質と推定される）のHsc70およびHsp40による効率的なHsp90非依存性in vitro活性化" . The Journal of Biological Chemistry . 278 (38): 36128– 36138. doi : 10.1074/jbc.M301069200 . PMID 12851401 .
外部リンク
- RfamのHBV RNAカプセル化シグナルεに関するページ
- HBVRegDB B型肝炎ウイルス（HBV）調節配列データベース（HBVRegDB）
