マイクロアレイ実験に関する最小情報(MIAME )は、マイクロアレイ実験を報告するためにFGED協会によって作成された標準です。[ 1 ]
MIAMEは、実験結果を明確に解釈し、実験を再現するために必要なすべての情報を指定することを目的としています。この規格は準拠レポートに必要な内容を定義していますが、このデータを提示する形式は指定していません。MIAMEは、マイクロアレイデータが容易に解釈でき、その分析から得られた結果を独立して検証できることを保証するために必要な最小限の情報を記述しています。[ 2 ]このデータを表現するために使用されるファイル形式は多数あり、このような実験のための公開リポジトリとサブスクリプションベースのリポジトリの両方があります。[ 2 ]さらに、MIAME準拠レポートの作成を支援するソフトウェアも存在します。
MIAMEは、生データ、正規化データ、サンプル注釈、実験計画、アレイ注釈、データプロトコルという6つの主要コンポーネントを中心に構成されています。
参考文献
- ↑ 「MIAMEホームページ」。FGED Societyウェブサイト。2012年9月13日取得。
- 1 2 Brazma, Alvis; Hingamp, Pascal; Quackenbush, John; Sherlock, Gavin; Spellman, Paul; Stoeckert, Chris; Aach, John; Ansorge, Wilhelm; Ball, Catherine A.; Causton, Helen C.; Gaasterland, Terry; Glenisson, Patrick; Holstege, Frank CP; Kim, Irene F.; Markowitz, Victor; Matese, John C.; Parkinson, Helen; Robinson, Alan; Sarkans, Ugis; Schulze-Kremer, Steffen; Stewart, Jason; Taylor, Ronald; Vilo, Jaak; Vingron, Martin (2001 年 12 月). 「マイクロアレイ実験に関する最小限の情報 (MIAME) ― マイクロアレイデータの標準化に向けて」 . Nature Genetics . 29 (4): 365–371 . doi : 10.1038/ng1201-365 . ISSN 1061-4036 . PMID 11726920 . S2CID 6994467 .