GIMIASについて GIMIASは、Graphical Interface for Medical Image Analysis and Simulation(医用画像解析およびシミュレーション用グラフィカルインターフェース)の略です。GIMIASは、画像、メッシュ、信号に関する主要なデータ入出力、可視化、およびインタラクション機能をすべて備えたグラフィカルユーザーインターフェースを 提供します。GIMIASの主な機能は以下のとおりです。
DICOM ブラウザとPACS 接続さまざまな画像診断モダリティ への対応2Dおよび3Dでの生体医療データ可視化:多平面再構成、直交スライスビュー、マルチスライスビュー、ボリュームレンダリング 、X線レンダリング、最大強度投影 複数の入出力フォーマットに対応:DICOM 、vtk、stl、Nifty、Analyze。 動画コントロール:再生、一時停止、速度調整 複数のデータオブジェクト:2D DICOM画像、3D画像、表面メッシュ、体積メッシュ、信号、または注釈 画像および表面メッシュの注釈:ランドマーク、測定値、関心領域 臨床ワークフローナビゲーションは、ユーザーが患者データから患者の治療に役立つ情報へとナビゲートするのを支援できます。[ 4 ] 画像分割 、メッシュ操作、信号ナビゲーションのためのその他の追加ツール。 [ 5 ] GIMIASは、開発者が動的にロードおよび組み合わせ可能なさまざまなプラグインを使用して独自の医療アプリケーションを作成できる開発フレームワークです。GIMIASで開発されたプロトタイプは、開発の初期段階でエンドユーザーが実際のシナリオと実際のデータを使用して検証できます。[ 6 ]
C++ 言語を使用して開発され、プラグイン アーキテクチャを持ち、標準のCMake ツールによってクロスプラットフォームに なっています。CSnakeツールを使用して新しいライブラリを統合することができ、VTK 、ITK 、MITK、BOOST 、wxWidgets などの一般的なオープンソースライブラリに基づいています。プラグインは、新しい処理コンポーネント、ツールバーやウィンドウなどのGUIコンポーネント、新しいデータ処理タイプ、または新しいレンダリングライブラリを追加してフレームワークを拡張できます。[ 7 ]
GIMIASは、シンプルなDLLから、 3D Slicer 互換のコマンドラインプラグイン、カスタマイズされたグラフィカルインターフェースを備えたより複雑なGIMIASプラグインまで、様々なタイプのプラグインをサポートしています。自動GUI生成と拡張可能なデータオブジェクトモデルにより、他のフレームワークとのプラグイン共有が可能になり、相互運用性が強化されます。
このソフトウェアは、Windows とLinuxの 64ビット版 と32ビット版 で利用可能です。[ 8 ]
歴史 オープンソースフレームワークの初期バージョンは2009年末までにリリースされた(GIMIAS 0.6.15は2009年10月にリリースされた)。[ 9 ]
2010年には、オープンソースフレームワーク自体の機能強化に力が注がれ、ワークフローマネージャー、3D Slicer プラグインとの互換性、シグナルビューア、カスタマイズ可能なビューなど、より多くの機能が提供されました。この年には、GIMIASバージョン0.8.1、1.0.0、1.1.0、1.2.0がリリースされました。
GIMIASチームは以下の団体と協力しました:
GIMIASは仮想生理人体 で使用されるツールの1つです。[ 14 ]
臨床プロトタイプ AngioLab は GIMIAS フレームワーク内で開発されたソフトウェア ツールであり、脳動脈瘤の統合管理のためのより野心的なパイプラインの一部です。AngioLab には現在、血管セグメンテーション、血管形態仮想ステント、仮想血管造影の 4 つのプラグインが含まれています。2009 年 12 月、23 人の臨床医が AngioLab に関する評価アンケートに回答しました。この活動は、スペインのバルセロナにあるポンペウ ファブラ大学で開催された第 2 回欧州低侵襲神経血管治療学会 (ESMINT) 教育コースで行われた教育コースの一部でした。自動形態分析 (血管形態プラグイン) と血管内治療計画 (ステント プラグイン) が評価されました。一般的に、これらのツールによって提供される結果は、臨床分野において関連性があり、新たなニーズであると考えられました。[ 15 ] [ 16 ] CardioLab :GIMIAS用のCardioLabスイートは、医用画像から 心筋 疾患の特性評価と定量化、心臓再同期療法(CRT) 計画まで、ワークフロー全体を実行できます。[ 17 ] FocusDET :難治性部分てんかんにおけるてんかん原性焦点の正確な局在は、治療としての手術の可能性を評価するために不可欠です。発作時および発作間欠期のSPECT画像とSISCOM法を用いたMRIを使用しててんかん原性焦点の位置を特定するための専用ソフトウェアパッケージが開発されました。FocusDETはGIMIASの施設を使用して開発されました。[ 18 ] QuantiDopa は、ドーパミン作動系神経伝達SPECT研究における線条体への取り込みを半自動的に定量化できるソフトウェアです。[ 19 ]
参考文献 ↑ I. Larrabide、P. Omedas、Y. Martelli、X. Planes、M. Nieber、JA Moya、C. Butakoff、R. Sebastián、O. Camara、M. De Craene、B. Bijnens、AF Frangi、 GIMIAS: 研究ツールと臨床プロトタイプの効率的な開発のためのオープンソース フレームワーク、心臓の機能イメージングとモデリング、417-426、 2009年。 ↑ 「VPH要件と技術評価演習」。仮想生理学的人間ネットワーク・オブ・エクセレンス。95ページ。 2011年7月20日にオリジナル からアーカイブ済み。 ↑ 「cvREMODウェブサイト」 。 2010年5月30日に オリジナル からアーカイブされました。 ↑ ahc. 「私は画像処理をしています」 。 ↑ P. Omedas; Y. Martelli; I. Larrabide; BH Bijnens; AF Frangi. "Advanced Tool for Visualization of Multi-modal and Multi-scale Cardiac Data" (PDF) . UPF. p. 42. 2011年6月15日に オリジナル (PDF) からアーカイブ済み。 ↑ 「GIMIASホームページ」 。 2011年7月20日に オリジナル からアーカイブされました。 ↑ GIMIASチーム(2010年8月5日)。 「GIMIASアーキテクチャ」 。slideshare。 ↑ Hamza Emadeen Mousa。 「GIMIAS 医療画像解析およびシミュレーションソリューション(WindowsおよびLinux用)」 。goomedic。 ↑ GIMIAS チーム。 「SourceForge の GIMIAS」 。SourceForge。 ↑ 「CMGUIとデータ融合」 。Virtual Physiological Human Network of Excellence。p. 30。 2011年7月20日に オリジナル からアーカイブ済み。 ↑ 「cmgui入門」 。オークランド生物工学研究所。 ↑ "CTK-Hackfest-May-2010" . ↑ 「B3Cコラボレーション」 (PDF) 。 2011年7月25日に オリジナル (PDF) からアーカイブされました。 ↑ 「仮想生理学的人間」 。2011年5月7日に オリジナル からアーカイブされました 。 ↑ MC Villa-Uriol、I. Larrabide、JM Pozo、H. Bogunovic、P. Omedas、V. Barbarito、L. Carotenuto、C. Riccobene、X. Planes、Y. Martelli、AJ Geers、AF Frangi、「AngioLab:頭蓋内動脈瘤の患者特異的管理のための統合技術」、第32回IEEE医用生体工学会(EMBS)年次国際会議、アルゼンチン、ブエノスアイレス、2010年 ↑ 「動脈瘤破裂のためのGIMIASツールチェーン」 。vph-noe。 2011年7月20日に オリジナル からアーカイブされました。 ↑ 「心臓再同期療法のインシリコモデリングのためのパイプラインの構築」 vph-noe.p.11. 2011年7月20日に オリジナル からアーカイブ済み 。 ↑ B. Martí; Ó. Esteban; X. Planes; P. Omedas; G. Wollny; A. Cot; X. Setoain; A. Frangi; M. Ledesma-Carbayo; J. Pavia (2009). "FocusDET: 難治性部分てんかんにおけるてんかん原性焦点の位置を特定するためのソフトウェアツール" . ENAM . ↑ 「VPH2010 会議発表スケジュール」 。vph-noe。 2011年7月20日に オリジナル からアーカイブされました。
外部リンク SourceForge.net (Linux Debian) ミトク