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1605年にはコペンハーゲンに小規模な医学講義室があったという記録があるが、1621年には大学の規約で本格的な解剖劇場を建設することが望ましいと強調された。1639年、クリスチャン4世はロストックからシモン・パウリをコペンハーゲンに呼び寄せ、解剖学、外科、植物学の教授に任命した。パウリは1643年、聖母教会の墓地（後のフルエ・プラッツ）を見下ろす大学の建物の1つを新しい解剖学講義室（Domus Anatomica）に改築するイニシアチブを取った。新しい施設は翌年に完成したが、パウリが最初の公開講義を行ったのは1645年3月3日であった。[ 1 ]
この施設と関係のあったもう一人の学者はトーマス・バルトリンである。彼は1662年に著した『Cista medica Hafniensis』の中で、この建物の詳細な記述を残している。
1681年にフィレンツェからコペンハーゲンに戻ったニールス・ステーンセンは、解剖学の発見によって国際的に名声を得ていたが、ドムス・アナトミカを再建した。カトリックに改宗したため教授職には就けず、代わりに王立解剖学者という称号で満足せざるを得なかった。1674年、彼はフィレンツェに戻った。
この建物は1728年のコペンハーゲン大火で完全に焼失した。その跡地には解剖外科劇場が建てられた。