深い眠り

明晰夢に興味を持つ、姿の見えない研究者は、探求するために心の中に世界を構築する。しかし、夢の中の世界はすぐに悪夢へと変わり、研究者は閉じ込められてしまう。正体不明の電話に促され、研究者は「目を覚まし」、何らかの方法で自由へと導く灯台を探さなければならない。影のような人影がこの世界を徘徊し、彼を捕らえようとする。先に進むために、彼は閉じ込められている建物の扉を開けていく。長い廊下の暗い部屋には、研究者に謎めいた出来事を伝える複数の新聞記事があり、この悪夢の領域に足を踏み入れたのは彼だけではないことを示唆している。ゲームの終盤近くになると、影のような人影が現れ始め、研究者に向かってくる。人影は殺すことができないため、彼は逃げなければならない。研究者は最終的に灯台にたどり着くが、灯台のランプを修復した後、影のような人影に追い詰められる。そして彼は影に光を当て、まるで影を追い払ったかのように見える。ゲームはプレイヤーが「目覚める」ことで終了する。しかし、研究者は影の人物たちへの好奇心を抱き続け、再び彼らに会いたいと宣言する。

前作の出来事を受けて、主人公は以前遭遇した影の人々に執着するようになり、彼らが実在する存在なのではないかと心配し始める。図書館で情報を探しているうちに、周囲の世界が崩壊し始め、彼らがすでに夢の世界に戻っていたことが明らかになる。ゲームプレイの多くは前作と同様で、プレイヤーは様々な部屋や建物を探索し、様々なアイテムを使ってゲームを進めていく。ゲームを進めるにつれて徐々に復元されていく破れた本のページは、影の人々の正体についてより深い洞察を与えてくれる。影の人々は、夢の世界にのみ存在する古代の異世界の存在であり、昏睡状態や明晰夢に囚われた人々の無人の体に憑依することで現実世界への脱出を望んでいると説明されている。このようにしてこの領域に侵入する人々は「旅人」と呼ばれる。冒険の途中で別の旅人に出会うことができ、それが前作の謎の電話の発信源であることが明らかになる。彼らは主人公が戻ってきたのは愚かだと説明し、前回のように再び上昇するには降りすぎたので、現実世界に「跳ね返る」ためには底まで降りなければならないと告げる。ゲームの終盤、プレイヤーは井戸に降りていき、頭上のシャドウピープルに捕らえられ、トンネルに入る。トンネルの暗闇の中で、プレイヤーは目のような光の球体を2つ見つける。その後ゲームは終了し、新聞記事が表示される。そこには、プレイヤーが以前トラのぬいぐるみをあげたコディという少年が3ヶ月の昏睡状態から目覚めて医師たちを困惑させたことが書かれており、夢の世界でのプレイヤーの行動が現実世界に影響を与える可能性があることを示している。

前作とは異なる時点から始まる本作では、プレイヤーはベッドで身動きが取れない状態で目を覚まし、部屋に影のような人影が現れ、短時間攻撃を仕掛けた後、姿を消すのを目にする。その後、プレイヤーは完全に「目覚め」、部屋を出るが、まだ夢の世界にいることに気づき、脱出を試みる。様々なアイテムを見つけ、様々な部屋を進んでいくと、プレイヤーは地下の下水道とトンネルの連なりに入る。そこには「底生生物」と呼ばれる巨大な夢の世界の捕食者が生息しており、プレイヤーはそれらを避けなければならない。下水道から脱出すると、プレイヤーは前作で探索した部屋に入り、井戸に降りた際に自分の体が憑依され、自分自身がシャドウ・パーソンになっていることに気づく。この事実に直面すると、プレイヤーは夢の世界で別の旅人と遭遇し、その旅人は逃げ出す。プレイヤーは、トラベラーを無傷で逃がして夢の世界に閉じ込めておくか、トラベラーの体を乗っ取ってシャドウパーソンとして破滅させるかの選択肢を与えられる。この人物は最初のゲームの主人公と同一人物であることが強く示唆されており、スクリプトウェルダーが開発した後のゲームでは、このトラベラーは同一人物だが並行世界から来た人物であると示唆されている。

ゲームの主人公はエイミーという女性で、兄トーマス（前3作に登場した名もなき旅人）の死後、彼のアパートに住み着く。兄は夢の世界に異常なほど執着しており、エイミーは兄が何らかの形で夢の世界にまだ存在していると信じ、毎晩、シデリアル・プレクサス製の機械を使って夢の世界を探検する。

旅の途中で、彼女は兄をよく知る守護者トゥトゥと出会う。また、兄を知る謎めいた旅人ジャーナリストのジョシュアや科学者のシュルツァー博士など、他の旅人たちとも出会う。しかし、恐ろしいナイトフォークをはじめとする、数多くの悪夢のような怪物にも遭遇する。そして、ナイトフォークに堕落させられた兄との対決へと繋がっていく。