日本DNAデータバンク

DNAデータバンク日本
コンテンツ
説明	日本DNAデータバンク
生物	全て
接触
研究センター	国際塩基配列データベース協力 ; 国立遺伝学研究所
研究室	生命情報・DNAデータバンクセンター
主な引用	11752245の
発売日	1786
アクセス
Webサイト	ホームページ

日本DNAデータバンク（DDBJ ）は、 DNA配列を収集する生物学データベースです。^[1]^[2]静岡県の国立遺伝学研究所（NIG）にあります。また、国際塩基配列データベースコラボレーション（INSDC ）のメンバーでもあります。欧州バイオインフォマティクス研究所の欧州分子生物学研究所および国立生物工学情報センターのGenBankと毎日データを交換しています。したがって、これら3つのデータバンクには常に同じデータが含まれています。

歴史

DDBJは1987年に国立遺伝学研究所でデータバンク活動を開始し^[3]、現在もアジアで唯一のヌクレオチド配列データバンクとなっている^{[4] 。}

組織

DDBJ は主に日本の研究者からデータを受け取っていますが、他の国の貢献者からのデータも受け入れることができます。DDBJ は主に日本の文部科学省(MEXT) から資金提供を受けています。DDBJ には、ヨーロッパ、米国、日本からそれぞれ 3 名ずつ、計 9 名のメンバーで構成される国際諮問委員会があります。この委員会は、年に 1 回、DDBJ の維持、管理、および将来の計画について助言します。これとは別に、DDBJ には、国際協力に関するさまざまな技術的問題について助言を行う、実務レベルの参加者で構成される国際協力委員会もあります。^{[引用が必要]}

参照

参考文献

^ Tateno Y, Imanishi T, Miyagi S, Fukami-Kobayashi K, Saitou N, Sugawara H, et al. (2002). 「生命科学におけるゲノム規模の研究のためのDNAデータバンク（DDBJ）」Nucleic Acids Res . 30 (1): 27–30. doi :10.1093/nar/30.1.27. PMC 99140 . PMID 11752245.
^ 上沼栄、小菅孝文、児玉勇、他 (2011年1月). 「DDBJ進捗報告」. Nucleic Acids Res . 39 (データベース号): D22–7. doi :10.1093/nar/gkq1041. PMC 3013661. PMID 21062814 .
^ 舘野裕; 五条堀徹 (1997年1月1日). 「情報生物学時代の日本DNAデータバンク」.核酸研究. 25 (1): 14–17. doi :10.1093/nar/25.1.14. PMC 146410. PMID 9016494 .
^ Tamang, Sanju (2019年2月22日). Aryal, Sagar (編). 「ヌクレオチドデータベース - 定義、種類、例、用途」. microbenotes.com . 2021年3月26日閲覧。

外部リンク

公式サイト
MetaBase の DDBJ エントリ。

[pmid11752245-1] Tateno Y, Imanishi T, Miyagi S, Fukami-Kobayashi K, Saitou N, Sugawara H, et al. (2002). 「生命科学におけるゲノム規模の研究のためのDNAデータバンク（DDBJ）」Nucleic Acids Res . 30 (1): 27–30. doi :10.1093/nar/30.1.27. PMC 99140 . PMID 11752245.

[pmid21062814-2] 上沼栄、小菅孝文、児玉勇、他 (2011年1月). 「DDBJ進捗報告」. Nucleic Acids Res . 39 (データベース号): D22–7. doi :10.1093/nar/gkq1041. PMC 3013661. PMID 21062814 .

[3] 舘野裕; 五条堀徹 (1997年1月1日). 「情報生物学時代の日本DNAデータバンク」.核酸研究. 25 (1): 14–17. doi :10.1093/nar/25.1.14. PMC 146410. PMID 9016494 .

[4] Tamang, Sanju (2019年2月22日). Aryal, Sagar (編). 「ヌクレオチドデータベース - 定義、種類、例、用途」. microbenotes.com . 2021年3月26日閲覧。