チャールズ・ローレンス（数学者）

チャールズ・"チップ"・ローレンスは、アメリカのバイオインフォマティクス学者および数学者であり、生物学的配列分析に対する新しい統計的アプローチの開発の先駆者です。

博士号取得後、ローレンスはレンセラー工科大学でシステム工学およびオペレーションズ・リサーチ・統計学の助教授となった。同時期（1971～1975年）、ローレンスはドミニカ共和国の母子保健省のコンサルタントとして勤務した。1975年から1981年まで、ニューヨーク州保健局疫学部門のオペレーションズ・リサーチ・統計部長として勤務した。

現在、彼はブラウン大学の応用数学教授であり、計算分子生物学センターに所属しています。^{[1] 2004年から2006年まで、彼は計算生物学センターの所長を務めていました。現在は}ブラウン大学の統計分子生物学グループ（SMBG）の所長です。

ローレンスのこれまでの主要科学研究は、生物学的配列分析に対するアルゴリズム的アプローチに焦点を当てています。実際、彼は、ゲノムプロセスの固有の統計的性質とゲノム配列決定プロジェクトから得られる膨大なデータは、統計アルゴリズムを使用することによってのみ完全に分析できることを認識した最初の人物の 1 人でした。

ローレンスは1967年にレンセラー工科大学で物理学を専攻し、 学士号を取得した。

レンセラー工科大学卒業後、コーネル大学でさらに学び、環境工学における応用オペレーション・リサーチと統計学という別の研究分野に移りました。1971年に博士号を取得しました。博士論文のテーマは人口動態です。

ローレンスは博士課程を終えるまでバイオインフォマティクスに転向しませんでした。

ローレンスは 1980 年代から計算生物学の分野で研究を始めました。アルゴリズム的アプローチに重点を置き、生物学的配列分析に対する新しい統計的アプローチの開発の先駆者でした。

ローレンスは、ベイズ統計とギブスサンプリング戦略を統合して修正因子発見問題にアプローチする配列アラインメントアルゴリズムの開発に特に貢献しました。1993年にサイエンス誌に発表された彼の独創的な論文では、統計手法ギブスサンプリングを多重配列アラインメントの問題に初めて適用したことが説明され、明確に示されました。^[2]

さらに、ローレンスは他の研究者と共同で、RNA の二次構造予測に対するベイズ統計的アプローチをさらに発展させ、RNA 分子がとる可能性のある構造の完全な集合の予測を大幅に容易にしました。

ローレンスは、ベイズアルゴリズムの応用、特に生物学的問題を理解するための統計的アプローチを研究しており、特に転写制御と配列内の制御モチーフの特定、アンチセンスオリゴヌクレオチドとsiRNAの設計、比較ゲノミクス、ヌクレオチド配列の構成、およびいくつかのタンパク質ファミリーの詳細な分析に興味を持っています。^[1]

過去数年間、ローレンスと彼の協力者による統計アルゴリズムの開発に基づいて、ギブス モチーフ サンプラー、^[3]、ベイズ アライナー、Sfold、^[4]、BALSA、ギブス ガウス クラスタリング、ベイジアン モチーフ クラスタリングなどのいくつかのプログラムも公開され、広く使用されるようになりました。ベイジアン統計における彼の研究は、2000 年に優れた応用ベイジアン統計論文としてミッチェル賞を受賞しました。

ローレンスはブラウン大学のチップ・ローレンス研究室の所長になった。彼らの研究は、調節モチーフの発見、RNA二次構造の予測、エピジェネティクスのゲノムワイド研究など、生物学的問題における高次元推論の応用に重点を置いている。さらに、彼の研究対象は、古気候記録の変化点推定や地質学的地層序の確率的アラインメントといった地球科学の分野にも広がっている。確率文法の応用モデルもチップ・ローレンス研究室で研究されている。^[5]

ローレンスは教育にも時間を費やしてきました。

彼はベイズ統計とギブスサンプリングに関するチュートリアル^[1]を開発したほか、ブラウン大学でベイズ統計の入門コースも開講した。

ローレンスはブラウン大学に着任する前に、何人かの若い研究者を指導してきました。1981年から2003年まで、ニューヨーク州保健局のワズワース研究所・研究センターの主任として勤務し、スティーブン・ブライアントなど多くの若いバイオインフォマティクス研究者が彼から指導を受けました。

ブライアント博士は現在、国立生物工学情報センター、国立医学図書館、国立衛生研究所の上級研究員として、計算生物学の分野で働いています。彼の専門は構造バイオインフォマティクスの分野です。ブライアント博士はまた、タンパク質構造、タンパク質ファミリー分類、ケモインフォマティクスのNCBI情報リソースチームを率いています。これらのチームは、NCBIの高分子構造データベースとCn3D視覚化ツール、保存ドメインデータベースとCDTree分析ツール、そして最近ではPubChemケモインフォマティクスデータベースと関連分析ツールを管理しています。^[6]

• 1971～1975年：レンセラー工科大学システム工学およびオペレーションズリサーチ・統計学助教授。
• 1971年～1975年：ドミニカ共和国母子保健省コンサルタント。
• 1975～1981年：ニューヨーク州保健局疫学部門オペレーションズリサーチおよび統計部長。
• 1981年～2003年：ニューヨーク州保健局ワズワース研究所・研究センター、バイオメトリクス/バイオインフォマティクス研究所長。
• 1985～1992年: ゼネラルモーターズ社ハリソンラジエーター部門統計コンサルタント
• 1992～1996年：国立生物工学情報センター（NLM-NIH）客員科学者。
• 2000～2003年：レンセラー工科大学コンピュータサイエンス学部研究教授（週1日）。
• 2004～2006年：ブラウン大学計算分子生物学センター所長、応用数学教授。
• 2004年～現在：ブラウン大学応用数学教授および計算分子生物学センター教授。

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