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ベン・ラングミード | |
|---|---|
| 生まれる | ベンジャミン・トーマス・ラングミード |
| 母校 | |
| 知られている | ボウタイシーケンスアライナー |
| 受賞歴 | ベンジャミン・フランクリン賞 （2016） |
| 科学者としてのキャリア | |
| フィールド | 計算生物学 |
| 機関 | ジョンズ・ホプキンス大学 |
| 論文 | シーケンスベースの比較ゲノミクスのためのアルゴリズムと高性能コンピューティングアプローチ (2012) |
| 博士課程の指導教員 | スティーブン・ザルツバーグ |
| Webサイト | www.cs.jhu.edu/faculty/ben-langmead/ |
ベン・ラングミードはジョンズ・ホプキンス大学の計算生物学・医学グループの計算生物学者および准教授である。[1] [2]
教育
ラングミードは2003年にコロンビア大学コロンビアカレッジでコンピュータサイエンスの学士号を取得しました。2009年にはメリーランド大学でスティーブン・ザルツバーグの指導の下、コンピュータサイエンスの理学修士号と博士号をそれぞれ取得しました。 [3]
キャリア
ラングミードは、配列アライメントのスケーラビリティを向上させるためにバロウズ・ウィーラー変換を実装したBowtie 配列アライメントアルゴリズム[4]の開発で知られています。2022年現在、Bowtieソフトウェアパッケージを説明するオリジナルのゲノム生物学論文は20,000回以上引用されています。 [アップデート]
ラングミードは2012年7月にジョンズホプキンス大学の助教授に就任した。[3]
受賞歴
ラングミードは、生命科学分野での無料かつオープンアクセスの資料の推進により、2016年にベンジャミン・フランクリン賞を受賞した。 [5]
参考文献
- ^ 「Benjamin Langmead - コンピュータサイエンス学部」。コンピュータサイエンス学部。 2017年3月23日閲覧。
- ^ Google Scholarにインデックスされた Ben Langmead の出版物
- ^ ab "Langmead CV" (PDF) . 2017年3月24日閲覧。
- ^ Langmead, Ben; Trapnell, Cole; Pop, Mihai; Salzberg, Steven L (2009). 「短い DNA 配列のヒトゲノムへの超高速かつメモリ効率の高いアラインメント」.ゲノム生物学. 10 (3): R25. doi : 10.1186/gb-2009-10-3-r25 . PMC 2690996. PMID 19261174 .
- ^ 「Benjamin Franklin Award - Bioinformatics.org」www.bioinformatics.org . 2017年3月23日閲覧。
外部リンク
TwitterのBen Langmead