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分子生物学において、オートトランスポータータンパク質はグラム陰性細菌から分泌されるタンパク質である。これらのβヘリックスには、分子内オートシャペロンドメインと呼ばれるドメインが必要である。このドメインは他の分子内シャペロン配列と類似性を示し、折り畳みに関連する機能を持つ。これにより、 βバレルを安定化させるか、あるいはパッセンジャードメインの折り畳みを促進することによって、輸送効率が向上する。
オートシャペロン領域は通常、HSFとパッセンジャー領域の間に位置します。パッセンジャー領域がC末端から転座する際、最初にオートシャペロン領域が転座します。これにより、ヘアピン構造が形成されます。