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| SAM依存性MTaseスーパーファミリー | |
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 アグロバクテリウム ツメファシエンス由来の SAM 依存性メチルトランスフェラーゼの結晶構造の分子構造の漫画表現 ( PDB : 2igt ) | |
| 識別子 | |
| シンボル | SAM 依存 MTases |
| エコド | 2003.1.5 |
| インタープロ | 著作権 |
| アドメット_MTase | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| シンボル | アドメット_MTase | ||||||||
| パム | PF07757 | ||||||||
| ファム一族 | CL0063 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
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S-アデノシルメチオニン依存性メチルトランスフェラーゼ（SAM-MTaseまたはAdoMet-MTase）は、保存されたタンパク質ドメインおよびタンパク質スーパーファミリーです。[1] SAM-MTaseタンパク質はメチルトランスフェラーゼです。[2] SAM-MTaseには5つのタンパク質ファミリーがあります。
SAM-MTaseはS-アデノシル-L-メチオニンをメチル化の基質として利用し、生成物S-アデノシル-L-ホモシステインを生成する。[3]
構造とサブグループ
すべてのSAM-MTaseは、中央の7本鎖βシートと、その両側に3つのαヘリックスが並ぶ構造的に保存されたSAM結合ドメインを含んでいます。[4]
2003年に発表されたレビューでは、すべてのメチルトランスフェラーゼを触媒ドメイン（フォールド）の構造に基づいて5つの主要なクラスに分類しています。[5]
- クラスI：ロスマン型α/β、最大のサブグループ。[3]
- クラス II: TIM β/α-バレル α/β
- クラス III: テトラピロールメチラーゼ α/β
- クラスIV: SPOUT α/β
- クラス V: SET ドメインすべて β
参考文献
- ^ Wang, Jiyao; Chitsaz, Farideh; Derbyshire, Myra K.; Gonzales, Noreen R.; Gwadz, Marc; Lu, Shennan; Marchler, Gabriele H.; Song, James S.; Thanki, Narmada; Yamashita, Roxanne A.; Yang, Mingzhang; Zhang, Dachuan; Zheng, Chanjuan; Lanczycki, Christopher J.; Marchler-Bauer, Aron (2023-01-06). 「2023年の保存ドメインデータベース」. Nucleic Acids Research . 51 (D1): D384–D388. doi :10.1093/nar/gkac1096. ISSN 1362-4962. PMC 9825596 . PMID 36477806.
- ^ Knizewski L、 Ginalski K (2006 年 7 月)。「DUF1613 は真核生物 のAdoMet 依存性メチルトランスフェラーゼの新規ファミリーです」。Cell Cycle。5 ( 14): 1580–2。doi : 10.4161/cc.5.14.2978。PMID 16861910。
- ^ ab 「CDD保存タンパク質ドメインファミリー：AdoMet_MTases」。www.ncbi.nlm.nih.gov 。 2023年12月7日閲覧。
- ^ Martin, Jennifer L; McMillan, Fiona M (2002-12-01). 「SAM (dependent) I AM: the S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase fold」. Current Opinion in Structural Biology . 12 (6): 783–793. doi :10.1016/s0959-440x(02)00391-3. ISSN 1879-033X. PMID 12504684.
- ^ Schubert, Heidi L; Blumenthal, Robert M; Cheng, Xiaodong (2003-06-01). 「メチル基転移への多くの経路：収束の記録」. Trends in Biochemical Sciences . 28 (6): 329–335. doi :10.1016/s0968-0004(03)00090-2. ISSN 0968-0004. PMC 2758044. PMID 12826405 .