オーストラリア国立ゲノム情報サービス( ANGIS )は、生物学者にバイオインフォマティクスソフトウェア、データベース、文書、トレーニング、サポートの包括的なシステムへのアクセスをサブスクリプションベースで提供していました。明らかにオーストラリアの研究者を対象としていましたが、ANGISが提供するツールは世界中の研究者がオンラインで利用できました。ANGISは2009年末に閉鎖されました。[1]
ツール
BioManager はANGIS が提供する主なリソースでした。ANGIS/Biomanager は 2009 年 11 月 30 日に閉鎖されましたが、シドニー大学の Peter Reeves 教授は引き続き BioManager [2]の実装を自主的にホストしています。BioManager は、元々は今は亡きオーストラリアのバイオインフォマティクス企業 Entigen(1) によって開発された以前のツールBioNavigatorから開発されました。 [3] BioManager は、単一の Webユーザー インターフェイスを介して複数のバイオインフォマティクス コンピュータ パッケージを統合して使用できるバイオインフォマティクス ワークフロー管理システムです。分析データはシステムに保存されるか、BioManager 内の他のパッケージへの入力として使用されます。ANGIS によって提供されていた BioManager はサブスクリプション ベースのサービスであり、オーストラリアとニュージーランドの学術コミュニティがアクセスできました。オーストラリアとニュージーランド以外からのアクセスは問い合わせ制でした。ANGIS はまた、科学コミュニティがこれらのツールをすぐに使用できるようにするためのさまざまなトレーニング リソースとコースを提供しました。
歴史
ANGISは1990年にシドニー大学のプロジェクトとして始まり、当初はトレバー・コール、アレックス・ライスナー、ピーター・リーブスが先頭に立っていた学際的な取り組みとして、シドニー大学配列解析インターフェース(SUSAI)と呼ばれていました。1年後の1991年、SUSAIはオーストラリアゲノム情報センター(AGIC)という政府公認の研究センターの設立によりANGISになりました。 [4] 2007年3月、ANGISの監督はオーストラリアのニューサウスウェールズ州にあるシドニー大学に引き継がれ、新たに設立されたシドニーバイオインフォマティクスの中に入りました。2010年12月31日のシドニーバイオインフォマティクスの閉鎖により、ANGISは組織として終了したようです。[5]
教育
ANGIS は、大学院生向けのトレーニング コースやワークショップに深く関わっています。一般的なバイオインフォマティクス アプリケーション ワークショップのほか、プロテオミクス、マイクロアレイ、データベース検索、系統学に関する専門ワークショップがシドニーや国内各地で開催されました。これらの分野の社内トレーニング コースの期間は 1 日から 4 日間でした。
BioManagerはオーストラリアやその他の国際大学の主要なバイオインフォマティクストレーニングツールとして使用されており[6]、ANGIS/BioManagerの学術サブスクリプションには学生が使用するための教育ログインが含まれていました。
参考文献
- ^ 「ANGIS/BioManager は閉鎖されました。 - シドニー大学」。シドニー大学出版局。2009 年 12 月 17 日。2010年12 月 27 日閲覧。
- ^ 「Biomanager.info Genomic Information Service」。2011年4月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2010年12月27日閲覧。
- ^ 「ANGIS History page」。2006年10月2日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2010年12月27日閲覧。
- ^ 「シドニーバイオインフォマティクスの閉鎖」 。 2010年12月27日閲覧。[永久リンク切れ ]
- ^ Cattley, Sonia; Arthur, Jonathan W. (2007 年 8 月). 「BioManager: 学部生向けバイオインフォマティクス研修における教育ツールとしてのバイオインフォマティクス Web アプリケーションの使用」. Briefings in Bioinformatics . 8 (7): 457–465. doi : 10.1093/bib/bbm039 .
注記
(1)eBioinformatics/Encompass/Entigenは2001年に閉鎖された
外部リンク
- バイオマネージャーサービス
