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| アラニン/グリシン:カチオン共輸送体 (AGCS) ファミリータンパク質 | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| シンボル | A3P053 | ||||||||
| パム | PF01235 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| プロサイト | PS00873 | ||||||||
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アラニンまたはグリシン:カチオン共輸送体 (AGCS) ファミリー(TC# 2.A.25)のメンバーは、 Na +および/または H +と共輸送してアラニンおよび/またはグリシンを輸送します。
構造と機能
AGCS ファミリーの既知のタンパク質は、長さが 445 ～ 550 のアミノアシル残基で、8 ～ 12 個の推定膜貫通 α ヘリックス スパナーを持っています。メンバーは 11 個の膜貫通セグメント (TMS) を持っている可能性があり、DagA (TC# 2.A.25.1.1) と AgcS (TC# 2.A.25.1.3) の場合に当てはまるようですが、Acp (TC# 2.A.25.1.2) には 8 個の TMS しかありません。これはおそらく切り詰められた結果です。2016 年初頭の時点で、これらのタンパク質の 3D 結晶構造データは存在しないようです。AGCS ファミリーのメンバーは、極限性耐塩性シアノバクテリアAphanothece halophyticaや好熱性細菌Bacillus PS3などの細菌や古細菌で発見されています。[1] [2] 2015年現在、このファミリーのうち機能的に特徴付けられているのは3つのメンバーのみです。これらのタンパク質は、APCファミリー（TC＃2.A.3）と限られた配列類似性を示しています。[3]メタノコッカス・マリパルディス由来のAgcSの高解像度構造は、X線結晶構造解析を使用して得られ、2019年に公開され、アミノ酸-ポリアミン-有機カチオントランスポータースーパーファミリーの他のメンバーと構造相同性を示しています。[4]
輸送反応
AGCSファミリーによって触媒される一般的な輸送反応は以下の通りである: [3]
アラニンまたはグリシン（出力）+ Na +または H +（出力） → アラニンまたはグリシン（入力）+ Na +または H +（入力）。
AGCSファミリーのタンパク質
現在、AGCS ファミリーに属するタンパク質は 10 種類あります。これらのタンパク質とその説明は、トランスポーター分類データベースで確認できます。
参考文献
- ^ Bualuang A, Kageyama H, Tanaka Y, Incharoensakdi A, Takabe T (2015). 「耐塩性シアノバクテリア Aphanothece halophytica におけるアラニンまたはグリシン陽イオン共輸送体ファミリーのメンバーの機能的特徴」.バイオサイエンス、バイオテクノロジー、生化学. 79 (2): 230–5. doi : 10.1080/09168451.2014.968091 . PMID 25421789. S2CID 205616830.
- ^ 金森正史、鎌田博史、八木澤博史、平田博史 (1999年3月). 「大腸菌における好熱性細菌PS3由来のアラニンキャリアタンパク質遺伝子の過剰発現」。生化学ジャーナル。125 (3): 454–9。土井：10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022308。PMID 10050032。
- ^ ab Saier MH. 「2.A.25 アラニンまたはグリシン:カチオン共輸送体 (AGCS) ファミリー」。トランスポーター分類データベース。Saier Lab バイオインフォマティクス グループ / SDSC。
- ^ Ma J, Lei HT, Reyes FE, Sanchez-Martinez S, Sarhan MF, Hattne J, Gonen T (2019年2月). 「ナトリウムアラニン共輸送体AgcSの基質結合および特異性の構造的基礎」。米国科学アカデミー紀要。116 ( 6 ):2086–2090。Bibcode : 2019PNAS..116.2086M。doi : 10.1073 / pnas.1806206116。PMC 6369739。PMID 30659158。
さらに読む
- ロディオノフ DA、ヘッベルン P、ユーデス A、テル ベーク J、ロディオノバ IA、エルケンス GB、他(2009 年 1 月)。 「原核生物におけるビタミンのモジュール式トランスポーターの新しいクラス」。細菌学ジャーナル。191 (1): 42–51。土井：10.1128/JB.01208-08。PMC 2612444。PMID 18931129。
- 鎌田 洋、秋山 哲、諸沢 英、太田 哲、浜本 哲、神部 哲 他（1992年10月）。 「好熱性細菌PS3のアラニンキャリアタンパク質の一次構造」。生物化学ジャーナル。267 (30): 21650–5。土井：10.1016/S0021-9258(19)36661-X。PMID 1400476。
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