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推定古細菌 2 TMS ホリン (A2-Hol) ファミリー(TC# 9.B.109) は、約 130 ～ 165 個のアミノアシル残基 (aas) のサイズで 2 つの膜貫通セグメント (TMS) を持つ、Nitrososphaerota由来の推定ホリン数個で構成されています。A2-Hol ファミリーに属するタンパク質の代表的なリストは、Transporter Classification Database で確認できます。古細菌Candidatus Nitrosoarchaeum limnia は、Toxin Secretion/Lysis Holin と呼ばれる隣接遺伝子をコードします。「toxin」遺伝子は、「グリコシルトランスフェラーゼ GBT 型スーパーファミリー」に属するとされる 325 aas の可溶性タンパク質をコードします。このタンパク質は、 NCBI BLAST 検索で他のグリコシルトランスフェラーゼを表示します。隣接する遺伝子は、132 aasと2 TMS（TC# 9.B.109.1.1）の小さなタンパク質をコードしており、そのサイズとトポロジーから判断すると、ホリンである可能性がある。このタンパク質のUniProtアクセッション番号はS2E3C4である。パラログは、この同じ生物（Candidatus Nitrosoarchaeum koreensis）および他の近縁種に見られる。 [1]
参照
さらに読む
- Saier, Milton H.; Reddy, Bhaskara L. (2015-01-01). 「細菌、真核生物、古細菌のホリン：バイオテクノロジーおよびバイオメディカルへの応用が期待される多機能異種遺伝子」。Journal of Bacteriology 197 (1): 7–17. doi :10.1128/JB.02046-14. ISSN 0021-9193. PMC 4288690. PMID 25157079.
- Wang, IN; Smith, DL; Young, R. (2000-01-01) 。「ホリン：バクテリオファージ感染のタンパク質時計」。Annual Review of Microbiology 54 : 799–825。doi :10.1146/ annurev.micro.54.1.799。ISSN 0066-4227。PMID 11018145 。
参考文献
- ^ 「9.B.109. 推定古細菌2 TMS Holin (A2-Hol) ファミリー」TCDB 。 2016年3月30日閲覧。
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