標的質量分析

ターゲット質量分析法は、特定の時間に特定の質量（ m/z ）のイオンに対して、複数段階のタンデム質量分析法（n=2または3のMS ^{n ）を使用する}質量分析技術です。 ^[1] m/zと時間の値は、以前の分析から得られた包含リストで定義されます。

標的分析では、実験中のどの時間ウィンドウにおいても、ノイズレベルを超えるすべての存在量範囲のすべてのイオンを徹底的に分析することができます。対照的に、非標的分析では、通常、実験時間全体にわたって最も豊富な50～100個のイオンしか検出できません。このような非標的分析の制限により、ヒト血清などの非常に複雑で非常に動的なサンプルの分析には適していません。^[2]

しかし、標的質量分析法の利用方法はまだ原始的な段階にあり、標的分析で使用される包含リストは通常​​、科学者によって手動で入力されます。さらに、実験全体で 1 つの包含リストのみが許可されます。このような手動プロセスは、労働集約的であり、エラーが発生しやすいです。これは主に、質量分析計を制御するソフトウェアが不足していることが原因です。

外部ソフトウェアのソリューションを通じて包含リストの生成を自動化する取り組みがいくつか行われてきました。2010年に、Wuら^[3]は、低存在量の糖ペプチドを同定する取り組みにおいて半自動の方法を導入しました。彼らは反復実験とオープンソースソフトウェアGLYPIDを通じて自動化を実装しました。^[4]わずかな変更を加えると、このアプローチは他の単純なサンプルや複雑なサンプルの分析にも使用できます。前述の利点に加えて、この半自動アプローチは、科学者が手動でイオンを選択したり機器を再較正したりする時間と労力を大幅に節約します。

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