単一波長異常回折

単波長異常回折（SAD）は、位相問題の解決を可能にすることでタンパク質やその他の生物学的高分子の構造決定を容易にする、X線結晶構造解析で使用される技術です。多波長異常回折（MAD）とは対照的に、SAD は単一の適切な波長で単一のデータセットを使用します。

MADと比較すると、SADは位相調整力が弱く、位相の曖昧さを解決するために密度の変更が必要です。^[1]この欠点は、SADの主な利点ほど重要ではありません。SADの主な利点は、結晶がビームに費やす時間を最小限に抑え、データ収集中に分子への潜在的な放射線損傷を減らすことです。また、SADでは重原子の選択肢が広がり、シンクロトロンビームラインなしで実施できます。^{[1]今日、セレンSADは、}セレノメチオニンを組み込む方法が開発されたため、実験的な位相調整によく使用されています。組み換えタンパク質。

SAD は「単一波長異常分散」と呼ばれることもありますが、この手法ではデータが単一波長で収集されるため、分散差は使用されません。

参照

参考文献

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さらに読む

WA Hendrickson (1985)。「複数波長での回折測定によるタンパク質構造の解析」。ACA 論文集第 21 巻。
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外部リンク

MAD フェージング — 例、図解、参考資料を含む詳細なチュートリアル。

コンピュータプログラム

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SHELX — Sheldrick GM (1998)。「SHELX: 高分子への応用」。S Fortier (編)。高分子構造を解く直接法。ドルドレヒト: Kluwer Academic Publishers。pp. 401–411。ISBN 0-7923-4949-0。

チュートリアルと例

エヴァンス、グウィンダフ (1994 年 10 月)。「最適な X 線エネルギーでのシンクロトロン放射を使用した多波長異常回折法: タンパク質結晶構造解析への応用」。博士論文。ウォーリック大学。

[PHENIX-1] 「PHENIX で使用される一般的な用語の辞書」。phenix - online.org。MAD : [...] エッジ周辺の異常散乱の違いにより、SAD 実験で見られる位相の曖昧さなしに位相角を計算できますが、通常、密度の修正は、簡単に解釈できるマップを取得するために必要です。 [...] 非常に強力ではありますが、MAD 位相合わせは、重原子の選択がより制限されていること、放射線による損傷を避けるのが難しいこと、シンクロトロンビームラインが必要であることなどから、SAD に比べて人気がやや低下しています。 [...] SAD: [...] SAD は、セレノメチオニンを組み込んだタンパク質で実行されることが多いですが、異常散乱する原子であればどれでも使用できます (データの品質が非常に高い場合は、硫黄も含む)。