単一塩基伸長

一塩基伸長（SBE）は、核酸上の特定の位置にあるヌクレオチド塩基の同一性を決定する方法です。この方法は、一塩基多型（SNP）を識別するために使用されます。

この方法では、オリゴヌクレオチドプライマーが核酸に沿った相補領域にハイブリダイズして二重鎖を形成し、プライマーの末端 3' 末端が識別されるヌクレオチド塩基に直接隣接します。DNA ポリメラーゼを使用して、オリゴヌクレオチドプライマーは、4 つのヌクレオチドターミネーターすべてが存在する状態で 1 つの塩基だけ酵素的に延長されます。これにより、調べるテンプレート内の塩基に相補的なヌクレオチドターミネーターが組み込まれ、識別されます。4 つのターミネーターすべてが存在すると、相補的でないヌクレオチドの誤った組み込みが抑制されます。組み込まれたターミネーターの ID を決定するには、蛍光標識、質量分析用の質量標識、同位体標識、およびハプテンで塩基をタグ付けして抗ハプテン抗体酵素複合体で発色検出する (たとえば、ELISA 形式による) など、多くのアプローチが考えられます。

この方法は、フィリップ・ゴーレット、マイケル・ナップ、リチャード・ダグラス、スティーブン・アンダーソンが Molecular Tool 社で働いていたときに発明しました。このアプローチは、ハイスループット SNP 遺伝子型判定用に設計され、当初は「Genetic Bit Analysis」(GBA) と呼ばれていました。Illumina, Inc. は、この方法を Infinium テクノロジー (http://www.illumina.com/technology/beadarray-technology/infinium-hd-assay.html) で使用して、ヒトゲノムの DNA メチル化レベルを測定しています。

• Philip Goelet、Michael R. Knapp、Stephen Anderson、(1999)、米国特許第5,888,819号。ワシントンDC：米国特許商標庁。