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配列特徴変異型（SFVT）とは、タンパク質内の特定の配列特徴の定義された配列変異（突然変異）を指します。タンパク質を考えると、そのアミノ酸配列が構造と機能を決定します。配列の一部の領域は主にタンパク質の折り畳み、つまり構造に関係し、他の領域は酵素触媒部位などのタンパク質の機能に関係します。多くの関連種において、対応するタンパク質の領域は種間で保存されますが、各位置の正確なアミノ酸は変化する可能性があり、実際によく変化します。機能領域の保存性と実際のアミノ酸の正確な変化の両方を明確に示すために、配列特徴変異型が定義されています。
配列特徴とは、基本的にタンパク質内のアミノ酸の集合であり、その集合は連続した範囲の場合もあれば、いくつかの離散的な残基の場合もある。ほとんどの配列特徴は実験結果に基づいているが、計算解析に基づくものもある。
各配列特徴について、異なる近縁種の多くのタンパク質間で変異が存在する。変異型は、その特徴における各位置の正確なアミノ酸を定義する。特徴における各位置の変異が大きいほど、変異型の数は多くなる。特定のタンパク質について、アミノ酸配列が決定されれば、その配列特徴の変異型が決定される。
SFVTは、多くの関連種にわたるタンパク質の機能を研究するために利用できる。このような研究は、いくつかのヒト病原体に対して実施されている。
SFVTは、インフルエンザタンパク質についてはインフルエンザ研究データベースで、デングウイルスについてはウイルス病原体データベースおよび分析リソースで入手可能です。