擬似Kタプルヌクレオチド構成

擬似Kタプルヌクレオチド組成、またはPseKNCは、Chouの擬似アミノ酸組成（PseAAC）から拡張されました。 ^[1] PseAACとPseKNCはどちらもベクター記述子ですが、前者はタンパク質またはペプチド配列を表し、後者はDNAまたはRNA配列を表します。

タンパク質およびペプチド配列の配列順序情報が完全に失われるのを避けるために、Kuo-Chen ChouによってPseAAC ^[1]が提案されました。DNAおよびRNA配列の問題に対処するために、疑似Kタプルヌクレオチド構成またはPseKNCが提案されました。^{[2] [3] [4]科学コミュニティの利便性のために、大規模な配列データセットを、さまざまな物理化学的特性の組み合わせの選択肢を持つ疑似ヌクレオチド構成に変換できる、無料で利用できる}PseKNC ^[2]と呼ばれるWebサーバーと、オープンソースパッケージのPseKNC-General ^[3]がそれぞれ2013年と2014年に開発されました。PseKNC-Generalは、従来のkタプルヌクレオチド構成、Moreau–Broto自己相関係数、Moran自己相関係数、Geary自己相関係数、タイプI PseKNC、タイプII PseKNCなど、いくつかのモードの疑似ヌクレオチド構成を生成できます。

計算プロテオミクスやプロテオーム解析における PseAAC と同様に、PseKNC も計算ゲノミクスやさまざまなゲノム解析の実行でますます使用されるようになっています。