海底岩石データベース

海洋底岩石データベース（PetDB）^[1]は、背弧盆地、若い海山、古い海洋地殻を含む中央海嶺で生成された火成岩と変成岩、マントルと下部地殻からのオフィオライトと陸生捕獲岩、およびダイヤモンドの地球化学に関する地球規模の地球化学データのリレーショナルデータベースです。これらのデータは、質量分析、原子発光分析、蛍光X線分析、湿式化学分析などの幅広い技術による全岩粉末、火山ガラス、鉱物の分析によって得られます。データは、PetDBデータマネージャーによって科学文献から編集され、系統的なメタデータレビュー後に入力されます。科学コミュニティのメンバーは、EarthChemライブラリに入力された特定のデータの入力を提案することもできます。PetDBは、K. Lehnertが率いるLDEOのIEDA施設のEarthChemグループによって管理されています。PetDBは、米国国立科学財団によってサポートされています。

^{PetDB [2]}の開発は、ラモント・ドハティ地球観測所（LDEO）^[3]の科学者C.ラングミュア（現在はハーバード大学）、W.ライアン、A.ブーランジェらによって1995年に始まりました。彼らは、ワールドワイドウェブとリレーショナルデータベースが、研究や授業における科学データの使用にどのような影響を与えるかを認識したのです。

PetDBの初期資金調達フェーズ（1996～2001年）では、データベース構造の開発とデータ値の登録が支援されました。資金調達の再開（2002～2007年）により、コロンビア大学国際地球科学情報ネットワークセンター（CIESIN）[ ^{4] [5]}が管理するORACLEベースの環境へのデータベースの移行、継続的なデータ入力、よりユーザーフレンドリーな設計によるWebインターフェースの強化が可能になりました。

PetDB は現在 EarthChem によって管理され、米国国立科学財団によって資金提供されており、地球サンプル登録システム (SESAR) や宇宙材料データ システム (AstroMat) などの関連プロジェクトのエコシステムの一部として Interdisciplinary Earth Data Alliance 施設によって管理されています。

PetDB は設立以来、幅広い科学的取り組みをサポートし、中央海嶺玄武岩、深海 ペリドタイト、さらには地球のマントルと下部地殻からの捕獲岩サンプルに関する地球化学データの包括的なグローバル データセットへの容易なアクセスを提供してきました。

PetDBのリレーショナルデータベース構造はサンプルベースの実装であり、あらゆる種類の岩石サンプルの化学、同位体、鉱物学のデータに加えて、各サンプルに関する情報（収集場所と時間、分類、岩石学的説明など）と、分析手順、参照標準測定などのデータ品質を提供する必須メタデータを収容するように設計されています（Lehnert et al. 2000 ^[6]）。

このリレーショナルデータモデルは、当初はPetDBとそのヨーロッパのカウンターパートであるGEOROC ^[7]向けに開発されましたが、その後の地球化学データベースプロジェクトへの応用によって有用性と柔軟性が実証されました。その中には、PetDBも促進してきたいくつかのコラボレーションを含む、その後の地球化学データベースプロジェクトへの応用があります。そのコラボレーションには、東アフリカ地溝帯のテフラサンプルに焦点を当てたEARThDプロジェクト、南極の岩石サンプルのメタデータを含むオハイオ州立大学の米国極地岩石リポジトリ、そして北米の花崗岩質プルトンサンプルのデータも含まれるようになったカンザス大学とのコラボレーションなどがあります。このプロジェクトはNAVDATプロジェクトから発展したものです。

PetDBは1500以上の査読付き科学論文で引用されています。^[8]

PetDB は、FAIR (検索可能、アクセス可能、相互運用可能、再利用可能)、TRUST (透明性、責任、ユーザー重視、持続可能性、テクノロジー)、および先住民データ ガバナンスの CARE 原則 (共同利益、管理権限、責任、倫理) に準拠したデータに取り組んでおり、すべての科学分野にわたって公開されているデジタル リソースの重要性を示すことを目指しています。

現在のアプリケーションでは、PetDB には化学パラメータの完全なセット (現在 250 種類以上の元素、酸化物、同位体、同位体比) が含まれており、洗練されたクエリ インターフェイスを通じて岩石学 (モード) データにもオンラインでアクセスできます。新しいデータは、著者によって公開され PetDB に送信されるたびに、データベースに継続的に追加されます。異なる研究室で生成された、またはさまざまな著者によって公開された特定のサンプルのデータは、データベース アプリケーションによって生成された一意のサンプル識別子を使用してリンクされ、統合されます。

2024年11月15日現在、PetDBの保有資産は以下のとおりです。

• 参照: 3,680
• サンプル数: 141,527
• 岩石データポイント: 1,796,265
• 鉱物: 3,549,654
• 火山ガラス: 937,401

• 収録数: 354,156
• 合計個別値: 6,639,789

PetDB のデータは、HTML テーブルで表示したり、XLS 形式のスプレッドシートにダウンロードしたりできます。化学パラメータの選択時に、ユーザーはデータを個別の値として取得するか (データ テーブルの各行には、同じサンプルで同じ方法で測定され、同じ参照にリンクされた値が含まれます)、プリコンパイルされた形式で取得するかを選択できます。プリコンパイルされた形式では、データが複数の出版物から取得されている場合でも、サンプルに関連付けられたすべてのデータが 1 行に配置されます。特定の化学項目に複数のデータ値がある場合、プリコンパイル アルゴリズムは最新の分析と最も正確な使用可能な方法を選択します。HTML テーブル内のリンクを使用すると、サンプル、参照、またはデータ値 (分析手順) に関する詳細情報にアクセスできます。最終的なスプレッドシート出力には、2 つのワークシートが含まれます。1 つ目は、クエリされた化学データ、地理空間座標、要約された方法と参照が含まれ、2 つ目は、分析方法と出版物情報に関するメタデータが含まれます。

• Alemayehu M、Zhang H-、Sakyi PA。エチオピア南部リフトゾーン下の岩石圏マントルの性質と進化：マントル捕獲岩の岩石学と地球化学からの証拠。国際地球科学ジャーナル。2016年。doi：10.1007/s00531-016-1342-z
• Braun, MG および PB Kelemen (2002)。「オマーンオフィオライトにおけるダナイトの分布: 多孔質ダナイト導管を通る溶融フラックスへの影響」G-CUBED 3(11): 8603. doi :10.1029/2001GC000289
• Chavrit, D.、Humler, E.、Grasset, O.(2014)「中央海嶺システム全体にわたる現代の CO2 フラックスとマントル炭素含有量のマッピング」EPSL 387:229-39。doi : 10.1016 /j.epsl.2013.11.036
• Cipriani, A.、HK Brueckner、他 (2004)。「謎の親によって生成された海洋地殻: 大西洋中央海嶺の玄武岩-ペリドタイトペアの Sr および Nd 同位体」GEOLOGY 32: 657-660. doi :10.1130/G20560.1
• Horsburgh JS、Aufdenkampe AK、Mayorga E、Lehnert KA、Hsu L、Song L、他「観測データモデル 2: 空間的に離散的な地球観測のためのコミュニティ情報モデル」。環境モデリングとソフトウェア。2016;79:55-74。doi :10.1016/ j.envsoft.2016.01.010
• Lehnert, KA、Su, Y.、Langmuir, CH、Sarbas, B.、Nohl, U.、「岩石のグローバル地球化学データベース構造」、G-CUBED、第 1 巻、2000 年。doi : 10.1029/1999GC000026
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• Weyer, S.、C. Muenker、他 (2003)。「枯渇したマントルにおける Nb/Ta、Zr/Hf、REE: 地殻マントル系の分化史への影響」EARTH PLANET SCI LETT 205: 309-324。doi : 10.1016/S0012-821X(02)01059-2