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この記事では、NCAAフットボール選手権サブディビジョンの編成の歴史、具体的には、1978年にNCAAディビジョンIフットボールが2つのサブディビジョンに分割されて以来、 NCAAディビジョンIカレッジフットボールの下位リーグで競ってきたすべての学校について解説します。これには、以下のリーグで競ってきた学校が含まれます。
太字斜体で表記されているチームは現在フットボールボウルサブディビジョン（FBS）に所属しています。通常の斜体で表記されているチームは、下位ディビジョンでフットボールをプレーしているか、あるいはフットボールを全くプレーしていません。アスタリスク（*）が付いているチームはフットボールから撤退しました。
日付は、チームがI-AA/FCSでプレーを開始した時期を示しており、ポストシーズン出場資格を得た時期を示すものではありません。
来たる2026年シーズンから、2校がFCSからFBSへ移行し、1校が新たにフットボール部を創設する。ノースダコタ州立大学は2026年から移行を開始し、そのシーズンはミッド・アメリカン・カンファレンス（MAC）でプレーオフ出場資格なしでプレーした後、2027年に正式メンバーとなる。サクラメント州立大学も同様に移行を開始し、そのシーズンはマウンテン・ウェスト・カンファレンス（MW）でプレーオフ出場資格なしでプレーした後、翌年に正式メンバーとなる。シカゴ州立大学は初めてフットボール部を創設し、FCSの独立校として活動した後、 2027年に同じくNECに加盟する。
移行を完了した最新の大学は、2025年シーズンに先立って移行を完了した。デラウェア大学とミズーリ州立大学はともに2024年にFBSへの移行を開始し、翌年にはCUSAに加盟したが、その時点ではボウルゲームへの出場資格はなかった。
アイダホ大学は、フットボールチームをFBSからFCSに格下げし、2018年7月に全スポーツが所属するビッグスカイカンファレンスにフットボールチームとして復帰した。同じく2018年7月、ノースアラバマ大学はNCAAディビジョンIIからの移行を開始し、当時はアトランティックサンカンファレンス（当時はASUNカンファレンスとして知られていた）にフットボール以外のスポーツで加入した。フットボールチームは2018年にFCSの独立チームとして活動した後、2019年にビッグサウスカンファレンスに加入した。
2020年にFCSに加わったのは、ディキシー州立大学（現在はユタ工科大学として知られる）とタールトン大学の2校である。両校ともディビジョンIへの移行を開始し、フットボールチームはFCSの独立校となり、他のすべてのスポーツはフットボール以外のウェスタン・アスレチック・カンファレンスに加わった。WACは2021年秋のシーズンにFCSレベルでフットボールを復活させ、サウスランド・カンファレンスから4校が加わった。現在フットボールのないWACの正会員であるUTRGVは、当初2024年までにFCSフットボールプログラムを開始すると発表したが、2025年の本格的な大学対抗戦の前に、それをエキシビションシーズンとした。
FCSに次に加わったのはセント・トーマス大学で、同校は2021年にフットボール以外のサミットリーグとパイオニアフットボールリーグに加わり、ディビジョンIIIからディビジョンIへの前例のない直接移行を果たした。その1年後、リンデンウッド大学、ストーンヒル大学、そして当時テキサスA&Mコマース大学として知られていたイーストテキサスA& M大学の3校がディビジョンIIからの移行の一環としてFCSに加わった。サウスダコタ州のディビジョンII校であるオーガスタナ大学（イリノイ州のディビジョンIIIのオーガスタナ大学とは別）はディビジョンIへの移行計画を発表したが、サミットリーグに却下された。
マーシーハースト大学とウェストジョージア大学は、2024年にディビジョンIIからFCSへの移行を開始すると発表した。続いてニューヘイブン大学が2025年、ウェストフロリダ大学が2026年に移行する予定だ。
つい最近、セントフランシス大学（ペンシルベニア州）は、2026年にフットボールを含むすべての運動部をディビジョンIからディビジョンIIIに直接降格させると発表した。
学校名は、現在使用されている名称を反映したものであり、必ずしもI-AA/FCSに所属していた当時の名称を反映したものではありません。具体的には、以下の学校は、ディビジョンI-AA/FCSに所属していた期間を通じて、異なる名称で知られていました。
2026年シーズンの編成は最新のものです。