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エーゲ海省 （ギリシャ語：Υπουργείο Αιγαίου）は、ギリシャの政府機関であった。1985年に設立され（法律1558/1985）、ミティリーニを本拠地とし、長らく無視されてきたエーゲ海諸島の開発を監督する任務を負っている。
2007年に商船省と合併し、商船・エーゲ海・島嶼政策省が発足した。新省はミティリーニに副大臣を置いた。2009年に省は分割され、商船部門は経済・競争力・海運省に吸収され、旧エーゲ海省はエーゲ海・島嶼政策事務局としてインフラ・運輸・ネットワーク省に吸収された。2010年9月、事務局は海洋・島嶼・漁業省に吸収された。