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哺乳類全体に広がる散在反復配列(MIR) は、一部の生物のゲノム内の転移要素であり、短鎖散在核要素 (SINE)のグループに属します。
入射
MIRはすべての哺乳類（有袋類を含む）に見られる。 [1]
人間の場合
ヒトゲノムには約368,000個のMIRが存在すると推定されている。[2]
構造
MIRコンセンサス配列は260塩基対の長さで、A/Tに富んだ3'末端を持っています。[1]
伝搬
他の短鎖核散在因子（SINE）と同様に、MIR因子はゲノム内での伝播にLINE因子の機構を利用し、これは約1億3000万年前に起こった。必要な逆転写酵素の活性が失われたため、MIR因子はもはや逆転写できない。[3]
発見の歴史
MIR要素は1989-1991年にヒトゲノムで初めて記述され[4] [5] [6] 、最初はMB1ファミリーリピート（マウスB1リピートの配列のミラー）と呼ばれていました。その後、このファミリーリピートは他の哺乳類ゲノムでも発見されました。[7] その後、このファミリーは1992年に「哺乳類散在リピート」に改名されました[8]後に、このファミリーは脊椎動物ゲノムに共通であることが示されました。[9]
参考文献
- ^ ab Smit, Arian FA; Riggs, Arthur D. (1995). 「MIR は、哺乳類の放射線の前に増幅された古典的な tRNA 由来の SINE です」。Nucleic Acids Research . 23 (1): 98– 102. doi :10.1093/nar/23.1.98. PMC 306635 . PMID 7870595.
- ^ Lander; et al. (2001). 「ヒトゲノムの初期配列決定と分析」(PDF) . Nature . 409 (6822): 860– 921. Bibcode :2001Natur.409..860L. doi : 10.1038/35057062 . PMID 11237011.
- ^ Krull, M; Petrusma, M; Makalowski, W; Brosius, J; Schmitz, J (2007 年 8 月). 「エクソン化された哺乳類全体の散在反復配列 (MIR) の機能的持続性」.ゲノム研究. 17 (8): 1139– 45. doi :10.1101/gr.6320607. PMC 1933517. PMID 17623809.
- ^ Donehower, Lawrence A.; Slagle, Betty L.; Wilde, Margaret; Darlington, Gretchen; Butel, Janet S. (1989). 「多くのヒト遺伝子の非コード領域における保存配列の同定」. Nucleic Acids Research . 17 (2): 699– 722. doi : 10.1093 /nar/17.2.699. PMC 331613. PMID 2536922.
- ^ Korotkov, Eugene V. (1990). 「ヒトゲノムからのミラーB1様配列ファミリー」. Dokl. Akad. Nauk SSSR (ロシア語). 311 (1): 238– 242. PMID 2357927.
- ^ Korotkov, Eugene V. (1991). 「ヒトゲノムで広く伝播するMB1リピートの新ファミリー」Mol Biol (Mosk) (ロシア語). 25 (1): 250– 263. PMID 1896037.
- ^ Korotkov, Eugene V. (1992). 「哺乳類ゲノムのクローンにおけるMB1ファミリーの反復配列」Izv Akad Nauk SSSR Biol (ロシア語) 7月– 8月 (4): 546– 557. PMID 1452902.
- ^ ジュルカ、ジェルジ;ワリチェヴィチ、ジョランタ。ミロサブリェヴィッチ、アレクサンダル（1992年10月）。 「ヒト反復 DNA のプロトタイプ配列」。分子進化ジャーナル。35 (4): 286–291。書誌コード:1992JMolE..35..286J。土井：10.1007/BF00161166。PMID 1404414。S2CID 22946894 。
- ^ Korotkov, Eugene V.; Korotkova, Maria A.; Rudenko, Valentina M. (2000). 「MIR - 脊椎動物ゲノムに共通する反復配列ファミリー」Mol Biol (Mosk) (ロシア語). 34 (4): 553– 559. doi :10.1007/BF02759556. PMID 11042848. S2CID 9524833.