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| コンテンツ | |
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| 説明 | ローカリゼーションの実験的注釈 |
| 生物 | ホモサピエンス シロイヌナズナ |
| 接触 | |
| 研究センター | コロンビア大学 |
| 研究室 | 生化学・分子生物物理学科 |
| 著者 | シュルティ・ラストギ |
| 主な引用 | ラストギら（2011）[1] |
| 発売日 | 2010 |
| アクセス | |
| データ形式 | MySQL データベース |
| Webサイト | http://www.rostlab.org/services/locDB |
| ウェブサービスURL | http://www.rostlab.org/services/locDB/search.php |
| その他 | |
| バージョン | リリース 1.0 |
LocDB [1]は、ホモサピエンス（ヒト）とシロイヌナズナ（雑草）におけるタンパク質の細胞内局在に関する実験的注釈を収集した、専門家がキュレーションしたデータベースです。このデータベースには、実験情報を含むすべてのタンパク質について、さまざまな最先端の予測方法による細胞内局在の予測も含まれています。
タンパク質は細胞の基本的な機能成分です。タンパク質は遺伝情報を物理的現実に変換する役割を担っています。これらの高分子は、遺伝子調節、酵素触媒、細胞代謝、DNA複製、栄養素の輸送、信号の認識と伝達を媒介します。ポストゲノム時代におけるタンパク質機能の解明のためにこの豊富なデータを解釈することは、根本的な課題です。現在までに、酵母などの最もよく研究されている生物でさえ、タンパク質の約4分の1が未だに特性評価されていません。実験的にタンパク質機能を決定する上での大きな障害は、研究に膨大なリソースが必要であることです。そのため、データベースに保存されている配列の量と、対応するタンパク質の実験的特性評価との間のギャップはますます大きくなっています。バイオインフォマティクスは、タンパク質機能のより迅速かつ効果的な予測のためのツールの開発を通じて、この配列と機能のギャップを埋める上で中心的な役割を果たしています。このリポジトリは、実験的注釈と予測との間のギャップを効果的に埋め、新しい予測方法のテストのためのより大きく信頼性の高いデータセットを提供します。[1]
参照
参考文献