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質量分析ソフトウェアは、質量分析におけるデータの取得、分析、または表現に使用されます。
プロテオミクスソフトウェア
タンパク質質量分析では、タンデム質量分析(MS/MS または MS 2とも呼ばれる) 実験がタンパク質/ペプチドの識別に使用されます。ペプチド識別アルゴリズムは、データベース検索とde novo検索の 2 つの大きなクラスに分類されます。前者の検索は、分析されたサンプルに存在すると想定されるすべてのアミノ酸配列を含むデータベースに対して行われます。対照的に、後者はゲノムデータの知識なしでペプチド配列を推測します。
データベース検索アルゴリズム
デノボシーケンスアルゴリズム
デノボペプチドシークエンシングアルゴリズムは、一般的に、Bartels et al. (1990) が提案したアプローチに基づいています。[27]
相同性検索アルゴリズム
MS/MSペプチド定量
その他のソフトウェア
参照
- 質量分析データ形式: 質量分析データ ビューアと形式コンバーターのリスト。
- タンパク質構造予測ソフトウェア一覧
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