コンピュータ支援有機合成ソフトウェア( CAOS)は、有機化学において計算化学と併用して、化学反応の設計、予測、および生成といった作業を容易にするために使用されるアプリケーションソフトウェアの一種です。CAOSは、出発物質から目的の分子を生成できる一連の化学反応を特定することを目的としています。CAOSアルゴリズムは通常、2つのデータベースを使用します。1つは既知の化学反応のデータベース、もう1つは既知の出発物質(通常は市販されている分子)のデータベースです。望ましい合成計画は、コストが低く、収率が高く、危険な反応や中間体の使用を回避します。CAOSは通常、計画問題として捉えられ、大きな進歩を遂げています。
CAOSプログラム
- CAS搭載のM1 RetroScore – デモ版あり。CAS SciFinderデータで学習した機械学習モデルに基づいています。
- シンテセウス –
- ChemAIRS – Chemical.AIが開発した商用ソフトウェアスイートで、デモが利用可能です。逆合成に加えて、SA (合成アクセス可能性) スコアやプロセス化学などの独自の機能も備えています。[ 1 ]
- Spaya – Iktosが提供する、無料で利用できる逆合成計画ツール。 2023年6月11日にWayback Machineにアーカイブされました。
- IBM RXNは、 IBMが開発したクラウドベースの無料サービスで、AIモデルを用いて化学反応を予測し、逆合成経路を生成します。有料会員向けには、ロボットとの連携やモデルの微調整といった追加機能も提供されています。
- AiZynthFinder –アストラゼネカとベルン大学の共同開発により開発された、自由にアクセスできるオープンソースの逆合成計画ツール。AiZynthFinderは、特定のターゲット化合物への合成経路を予測し、公開ソースまたは独自ソースのいずれであっても、ユーザー自身のデータセットで再学習させることができます。 [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]
- Manifold –化合物検索および逆合成計画ツール。学術ユーザーは無料で利用可能。PostEra社開発。 2022年1月13日にWayback Machineにアーカイブ済み。
- WODCA – 試用版なし。独自ソフトウェア[ 5 ]
- 有機合成探索ツール(OSET) –オープンソースソフトウェア、開発中止[ 6 ]
- CHIRON – 試用版なし。独自ソフトウェア[ 7 ]
- SynGen – デモ版;独自開発ソフトウェア;自動有機合成生成のための独自のプログラム;特定の標的有機化合物に対して最短かつ最も低コストの合成経路を生成することに重点を置いており、合成計画に役立つツールです。
- LHASA – デモは利用可能だがリンクされていない(?);独自開発ソフトウェア
- SYLVIA – デモ版。独自のソフトウェア。有機化合物の合成の容易さを迅速に評価します。合成の複雑さに基づいて、数千の構造(例えば、de novo設計実験によって生成されたもの、または大規模な仮想化合物ライブラリから取得されたもの)の優先順位付けが可能です[ 8 ]。
- ChemPlanner(旧称ARChem – Route Designer)は、化学者が目的分子の実現可能な合成経路を設計するのに役立つエキスパートシステムです。反応規則の知識ベースは反応データベースからアルゴリズム的に導出され、市販の出発物質が逆合成探索の終点として使用されます。
- ICSYNTH – デモ版あり。独自開発ソフトウェア。化学者が標的分子の合成経路と多段階対話型合成ツリーを生成できるコンピュータ支援合成設計ツール。その中核には、反応データベースから自動的に生成される変換ライブラリのアルゴリズム化学知識ベースがある。[ 9 ]
- Chematica(現在はSynthiaとして知られている)
- ASKCOS – 合成計画および計算化学ツールのオープンソーススイート。[ 10 ]
参考文献
- ↑ "Chemical.AI" . chemical.ai . 2025-02-05に取得.
- ↑ AiZynthFinder GitHub
- ↑ AiZynthFinder論文
- ↑ AiZynthFinder: 医薬品分野におけるデータセットとその性能に関する論文
- ↑ WODCA
- ↑ OSET
- ↑ "CHIRON"。2015年4月16日にオリジナルからアーカイブ済み。2013年2月18日に取得。
- ↑シルビア
- ↑ ICSYNTH
- ↑ "ASKCOS MIT" . askcos.mit.edu . 2025年5月11日取得.