キューバ政府は1880年代に初めて日本人労働者を砂糖農園に採用しようとしたが、日本政府はキューバにおける中国人労働者の劣悪な労働条件を理由に承認を拒否した。その後、記録に残る最初の日本人がキューバに定住したのは1903年のことだった。最初の大きな集団は1910年から1916年の間にメキシコからやって来た。これは後の数十年のパターンを決定づけるもので、彼らはメキシコ革命中の暴力から逃れてきた人々だった。[ 2 ]
彼らはカルメリナに農業組合を設立した。その後、1916年に262人の日本人が到着した。彼らのほとんどはサトウキビの収穫で仕事を見つけようとした。しかし、日本人にとって状況は非常に厳しく、一部は日本に帰国した。一部の人々はフベントゥド島にたどり着き、そこで家族で果物や野菜の農園を始めた。1926年、キューバへの移民は減少した。
1941年12月9日、日本が真珠湾を攻撃した後、バティスタ大統領は日本とそのファシスト同盟国に宣戦布告した。数日後の12月12日、キューバに住むすべての日系人が「敵性外国人」と宣告された。1943年までに、約200人の沖縄出身者を含む約1,200人の日本人がキューバに移住していた。ほとんどの日系キューバ人はキューバ政府に逮捕され、米国に強制送還された。到着後、新しい仕事を見つけた人もいた。料理人、使用人、その他の形で支援に従事した人もいた。投獄された人々は、戦争が終わってもすぐに釈放されたわけではなかった。最後のグループが釈放されたのは、日本が降伏してから6か月以上経った1946年3月だった。第二次世界大戦後、日本へ帰国した人もいた。
キューバ革命の間、より多くの日系人がキューバから日本へ移住した。
2008年、日本政府はフランシスコ・シンイチ・ミヤサカ・マチダ氏に、キューバ在住の日本人移民の子孫の福祉への貢献を称え、旭日金銀章を授与した。 [ 3 ]
2019年には、キューバには推定1,200人の日系人が住んでいた。[ 1 ]