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『JAG』の第6シーズンは、2000年10月3日にCBSで初放送され、2001年5月22日に最終回を迎えた。デヴィッド・ジェームズ・エリオットとキャサリン・ベルが主演を務めたこのシーズンは、ベリサリウス・プロダクションズがパラマウント・テレビジョンと共同で制作した。
サラ・“マック”・マッケンジー中佐（キャサリン・ベル）とハーモン・“ハーム”・ラッブ・ジュニア司令官（デヴィッド・ジェームズ・エリオット）は、海軍省の法務総監本部に配属された弁護士で、統一軍事裁判法（UCMJ）に基づき刑事事件の起訴と弁護を担当している。ハームとマックは、スパイ行為（「レガシー」）、密航者（「フロリダ海峡」）、航空機の故障（「フライト・リスク」）、宗教法違反（「王女と下士官」）、ベトナム戦争の戦争犯罪（「別々の平和」）、NATOの衝突事故（「衝突コース」）など、数多くの事件を捜査する。今シーズンの後半では、バド（パトリック・ラボーテュー）が娘の死を海軍の医師のせいにする（「家族の秘密」）、ケイトリン・パイク司令官（アンドレア・パーカー）がJAG本部に復帰する（「タッチ・アンド・ゴー」）、チェグウィデン提督（ジョン・M・ジャクソン）が昇進審査委員会の委員長を務める（「ベイビー、外は寒いよ」）、ミック（トレヴァー・ゴダード）とマックが婚約する（「命綱」）。また、ハームが海で行方不明になる（「漂流」）、ハリエットが中尉に昇進する（「命綱」）、マックが米国海軍兵学校で歴史に関する講演を行う準備をする（「反乱」）。
当時、海軍法務総監を務めていたドナルド・J・グーター少将は、第18話「自由」の制作中に撮影現場を訪れた。
また、このシーズンでは、JAGは海兵隊の訓練施設キャンプ・ペンドルトンでシーンを撮影した。「海兵隊との協定に基づき、番組のプロデューサーは、海兵隊が脚本を承認する代わりに、部隊、戦闘装備、軍事訓練へのアクセス権を得ている」[ 1 ] 。ドナルド・P・ベリサリオは、軍が特に協力的だったと評価し[ 1 ] 、シリーズのスターであるキャサリン・ベルは、 JAGは「やればできる小さな番組になった。それは続いて成長し続けている」と述べた[ 2 ] 。
