イソクエン酸リアーゼファミリー

利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
ＰＤＢ	1f61 A:9-427 1f8m C:9-427 1f8i D:9-427 1igw D:7-434 1dqu A:14-535 1zlp B:104-184 1ujq B:80-161 1o5q A:80-161 1xg4 A:80-161 1xg3 C:80-161 1mum A:80-161 1oqf B:80-161 1mzxA :80-161

イソクエン酸リアーゼファミリー
イソクエン酸リアーゼファミリー
識別子
シンボル	ICL
パム	PF00463
インタープロ	著作権
プロサイト	PDOC00145
SCOP2	1f8m / スコープ / SUPFAM
医療機器	cd00377
パム
利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
ＰＤＢ	1f61 A:9-427 1f8m C:9-427 1f8i D:9-427 1igw D:7-434 1dqu A:14-535 1zlp B:104-184 1ujq B:80-161 1o5q A:80-161 1xg4 A:80-161 1xg3 C:80-161 1mum A:80-161 1oqf B:80-161 1mzxA :80-161

イソクエン酸リアーゼファミリーは進化的に関連したタンパク質のファミリーです。

イソクエン酸リアーゼ（EC 4.1.3.1）^[1]^[2]は、イソクエン酸からコハク酸とグリオキシル酸への変換を触媒する酵素です。これは、細菌、真菌、植物におけるトリカルボン酸回路の代替であるグリオキシル酸バイパスの最初のステップです。システイン、ヒスチジン、グルタミン酸またはアスパラギン酸が酵素の触媒活性に重要であることがわかっています。真菌、植物、細菌の酵素の配列間で保存されているシステイン残基は1つだけで、保存されたヘキサペプチドの中央に位置しています。

このファミリーに属する他の酵素には、1-カルボキシビニルカルボキシホスホネートから3-(ヒドロヒドロキシホスホリル)ピルビン酸二酸化炭素への変換を触媒するカルボキシビニルカルボキシホスホネートホスホリルムターゼ( EC 2.7.8.23)や、ホスフィノトリシントリペプチド抗生物質の生合成に関与するホスホエノールピルビン酸ムターゼ( EC 5.4.2.9)などがあります。

亜科

イソクエン酸リアーゼ InterPro : IPR006254
メチルイソクエン酸リアーゼ InterPro : IPR012695
カルボキシビニルカルボキシホスホネートホスホリルムターゼ InterPro : IPR012697

参考文献

^ Beeching JR ( 1989). 「大腸菌由来イソクエン酸リアーゼとトウゴマ由来イソクエン酸リアーゼの配列は高度に保存されている」。タンパク質配列データ解析。2 (6): 463–466。PMID 2696959。
^ Tanaka A, Atomi H, Ueda M, Hikida M, Hishida T, Teranishi Y (1990). 「n-アルカン同化酵母Candida tropicalisのペルオキシソームイソクエン酸リアーゼ：遺伝子解析と特性評価」J. Biochem . 107 (2): 262–266. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123036. PMID 2361956.

この記事にはパブリックドメインのPfamおよびInterPro : IPR000918からのテキストが組み込まれています。

[PUB00005064-1] ^ Beeching JR ( 1989). 「大腸菌由来イソクエン酸リアーゼとトウゴマ由来イソクエン酸リアーゼの配列は高度に保存されている」。タンパク質配列データ解析。2 (6): 463–466。PMID 2696959。

[PUB00002339-2] Tanaka A, Atomi H, Ueda M, Hikida M, Hishida T, Teranishi Y (1990). 「n-アルカン同化酵母Candida tropicalisのペルオキシソームイソクエン酸リアーゼ：遺伝子解析と特性評価」J. Biochem . 107 (2): 262–266. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123036. PMID 2361956.