A. ムラト・エレン

A. ムラト・エレン（メレン）は、微生物生態学の研究や、大規模データセットの分析のための斬新なオープンソースの計算ツールの開発で知られるコンピュータ科学者である。

エレンはトルコのバルハル渓谷で育ち、チャナッカレ・オンセキズ・マルト大学^{[ 1 ]}で暗号学を専攻し、2002年に理学士号を取得しました^{[ 2 ]。}その後、米国に移住し、ニューオーリンズ大学で博士課程を開始しました。ニューオーリンズ小児病院で勤務中に、マイケル・フェリスから微生物学を紹介されました。2011年に博士号を取得し、博士論文のタイトルは「ヌクレオチド変異による微生物多様性の評価」でした^{[ 3 ]}。

エレンの博士課程の研究は、ハイスループットシーケンスデータセット内の微生物の多様性を調べるための計算手法であるオリゴタイピング^{[ 4 ]}の開発に関わっていました。博士号取得後、エレンは海洋生物学研究所に博士研究員として加わり、その間、ヒトの泌尿生殖器系^{[ 5 ]}、口腔^{[ 6 ] [ 7 ] 、下水[ 8 ]}に生息する微生物にオリゴタイピングを適用しました。2015年、彼はシカゴ大学に助教授として加わり^{[ 9 ]} 、そこでメタゲノミクスを使用して、ヒトの腸^{[ 10 ]}、ヒトの口^{[ 11 ] [ 12 ]} 、および表層海洋で見られる微生物の生態と進化を調査し始めました。^{[ 13 ]} 2022年、エレンはオルデンブルク大学およびアルフレッド・ウェゲナー極地海洋研究所の生態系データ科学教授に任命された。^{[ 14 ]}

エレンはオープンソースソフトウェアの支持者であり^{[ 9 ]} 、大規模データセットの分析と視覚化を可能にするプラットフォームであるanvi'o ^{[ 15 ]}のコミュニティ開発を主導している^{[ 16 ] 。}

• エレン、A. ムラット;エセン、オズカンC.クインス、クリストファー。ヴィネイス、ジョセフ H.モリソン、ヒラリー G.ソギン、ミッチェル L.トム・O・デルモント（2015年10月8日）。「Anvi'o: 「オミクスデータ」の高度な分析および視覚化プラットフォーム。ピアJ。3 e1319。土井：10.7717/peerj.1319。ISSN 2167-8359。PMC 4614810。PMID 26500826。   
• Eren, A. Murat; Maignien, Loïs; Sul, Woo Jun; Murphy, Leslie G.; Grim, Sharon L.; Morrison, Hilary G.; Sogin, Mitchell L. (2013). "オリゴタイピング: 16S rRNA遺伝子データを用いた近縁微生物分類群の識別" . Methods in Ecology and Evolution . 4 (12): 1111– 1119. Bibcode : 2013MEcEv...4.1111E . doi : 10.1111/2041-210X.12114 . hdl : 1912/6377 . ISSN 2041-210X . PMC 3864673 . PMID 24358444 .   
• Eren, A. Murat; Zozaya, Marcela; Taylor, Christopher M.; Dowd, Scot E.; Martin, David H.; Ferris, Michael J. (2011年10月25日). "微妙なヌクレオチド変異による一夫一婦制カップルの泌尿生殖器微生物叢におけるGardnerella vaginalisの多様性の探索" . PLOS ONE . 6 (10) e26732. Bibcode : 2011PLoSO...626732E . doi : 10.1371/journal.pone.0026732 . ISSN 1932-6203 . PMC 3201972 . PMID 22046340 .   
• Eren, A. Murat; Morrison, Hilary G.; Lescault, Pamela J.; Reveillaud, Julie; Vineis, Joseph H.; Sogin, Mitchell L. (2015 年 4 月) 「最小エントロピー分解: 高スループットマーカー遺伝子配列の感度の高い分割のための教師なしオリゴタイピング」 . The ISME Journal . 9 (4): 968–979 . Bibcode : 2015ISMEJ...9..968E . doi : 10.1038 / ismej.2014.195 . ISSN 1751-7370 . PMC 4817710. PMID 25325381 .   

• アルフレッド・P・スローン財団海洋科学研究フェローシップ（2020年）^{[ 17 ]}
• アメリカ微生物学会環境研究若手研究者賞（2021年）^{[ 18 ]}
• 寄生虫研究賞持続的寄生（2022年）^{[ 19 ]}

• A. ムラト・エレン氏の論文（Google Scholarに掲載）
• メレン研究所