ユニペプト

原作者	ゲント大学
開発者	バート・メスエール
初回リリース	2011年2月3日; 13年前
安定版リリース	4.1.1 / 2019年1月21日; 5年前
リポジトリ	github.com/unipept/unipept ;
書かれた	Ruby、JavaScript
タイプ	バイオインフォマティクス、データ可視化
ライセンス	MITライセンス
Webサイト	翻訳元

Unipeptは、メタプロテオミクスサンプルの生物多様性分析のためのオープンソースの研究ツールです。バイオマーカーとして使用するペプチドを選択するツールや、タンパク質含有量に基づいて生物のゲノムを比較するツールも含まれています。^[2]^{[3]このソフトウェアは}ゲント大学で開発されました。

Unipeptは、Webアプリケーションとスタンドアロンのコマンドラインツールで構成されています。Webアプリケーションは、インタラクティブなデータ視覚化を使用してデータセットを探索します。コマンドラインツールには同じ機能が含まれていますが、自動データ処理パイプラインで使用するように設計されています。^[4]

参考文献

^ 「Unipept Releases」。GitHub 。 2019年4月14日閲覧。
^ Mesuere, Bart; Devreese, Bart; Debyser, Griet; Aerts, Maarten; Vandamme, Peter; Dawyndt, Peter (2012). 「Unipept: トリプシンペプチドに基づくメタプロテオームサンプルの生物多様性分析」。Journal of Proteome Research . 11 (12): 5773–80. doi :10.1021/pr300576s. ISSN 1535-3893. PMID 23153116.
^ メスエレ、バート;デバイサー、グリート。アーツ、マーテン。バート・ディヴリーズ;ヴァンダム、ピーター。ピーター・ドーウィント (2015)。「Unipept メタプロテオミクス解析パイプライン」。プロテオミクス。15 (8): 1437–1442。土井：10.1002/pmic.201400361。ISSN 1615-9853。PMID 25477242。S2CID 43820480 。
^ 「Unipept CLI ドキュメント」。2015年8 月 24 日閲覧。

外部リンク

ユニペプトホームページ
Unipept コマンドラインツール
Unipept オープンソースプロジェクト

[1] 「Unipept Releases」。GitHub 。 2019年4月14日閲覧。

[MesuereDevreese2012-2] Mesuere, Bart; Devreese, Bart; Debyser, Griet; Aerts, Maarten; Vandamme, Peter; Dawyndt, Peter (2012). 「Unipept: トリプシンペプチドに基づくメタプロテオームサンプルの生物多様性分析」。Journal of Proteome Research . 11 (12): 5773–80. doi :10.1021/pr300576s. ISSN 1535-3893. PMID 23153116.

[MesuereDebyser2015-3] メスエレ、バート;デバイサー、グリート。アーツ、マーテン。バート・ディヴリーズ;ヴァンダム、ピーター。ピーター・ドーウィント (2015)。「Unipept メタプロテオミクス解析パイプライン」。プロテオミクス。15 (8): 1437–1442。土井：10.1002/pmic.201400361。ISSN 1615-9853。PMID 25477242。S2CID 43820480 。

[4] 「Unipept CLI ドキュメント」。2015年8 月 24 日閲覧。