連続歩行

シーケンシャル ウォーキングは、さまざまな 2D NMRスペクトルを解くために使用できる手法です。2D 実験では、クロス ピークを正しい核に関連付ける必要があります。シーケンシャル ウォーキングを使用すると、正しい核をクロスピークに割り当てることができます。割り当てられたクロスピークは、核間の空間的相互作用などの貴重な情報を提供します。

たとえば、 DNAのNOESYでは、各ヌクレオチドにはそれぞれ異なる化学シフトが関連付けられています。一般に、A は下流、T は上流、C と G は中間です。各ヌクレオチドはデオキシリボース糖にプロトンを持っており、シーケンシャル ウォーキングを使用して割り当てることができます。これを行うには、シーケンスの最初のヌクレオチドを検出する必要があります。DNA シーケンスを知っておくと役立ちますが、一般に、最初のヌクレオチドは次のルールを使用して決定できます。

1. ヌクレオチドの 2' および 2" プロトンは、その列だけでなく、配列内の次のヌクレオチドの列にも表示されます。たとえば、配列 CATG の C の列には、そのヌクレオチド自身の 2' および 2" プロトンが表示されますが、他のヌクレオチドのプロトンは表示されません。A の場合、そのヌクレオチド自身の 2' および 2" プロトンと、C のプロトンが表示されます。

2. ヌクレオチドのメチル基は、メチル基を含むヌクレオチドの列と、その前のヌクレオチドの列に表示されます。たとえば、CATG では、A と T には T のメチル基に対応するメチルピークが含まれますが、G には含まれません。

最初のヌクレオチドが見つかったら、その隣のヌクレオチドがどれであるかを判断します。そのヌクレオチドには、前のヌクレオチドの 2' および 2" プロトンが含まれているはずです。これは、スペクトルを「歩く」ことによって行われます。このプロセスは、すべてのヌクレオチドが割り当てられるまで、順番に繰り返されます。