モチビュー

MochiView（Mo tif and ChI P Viewer）^[1]は、ゲノムブラウザとデータおよび配列モチーフの視覚化および分析ツールを統合したソフトウェアです。このソフトウェアはJava言語を使用し、完全に統合されたJavaDBデータベースを備えており、プラットフォームに依存せず、無料で利用できます。

説明

MochiViewはもともと、 ChIP-chipおよびChIP-Seqデータから配列モチーフを迅速に閲覧、視覚化、および抽出するためのプラットフォームとして設計されました^{[いつ? ] 。このソフトウェアは、}RNA-Seqデータの視覚化と分析、または配列モチーフライブラリのインポート、保守、調査、および分析など、他の目的にも役立つ汎用データ形式を使用します。MochiViewのWebサイト^[2]には、ソフトウェアの詳細な機能リスト^[3]とデモビデオ^{[4]があり、スムーズなパン/ズーム、データ/遺伝子/配列/座標ブラウザー、プロットのインタラクティブ性を示しています。このソフトウェアは}、カリフォルニア大学サンフランシスコ校のAlexander Johnson研究室のOliver Homannによって作成されました。

参考文献

^ Homann ORとJohnson AD。MochiView：ゲノムブラウジングとDNAモチーフ解析のための多目的ソフトウェア。BMC Biology。2010年、8:49 [1]
^ MochiView ウェブサイト: メインページ 2010-08-13 にWayback Machineでアーカイブ
^ 「MochiView ウェブサイト: 機能一覧」。2010 年 8 月 13 日時点のオリジナルよりアーカイブ。2010 年 5 月 12 日閲覧。
^ 「MochiView ウェブサイト: サンプルビデオ」。2010 年 8 月 13 日時点のオリジナルよりアーカイブ。2010 年 5 月 12 日閲覧。

外部リンク

MochiViewウェブサイト[2]

[MochiView_BMC_Paper-1] Homann ORとJohnson AD。MochiView：ゲノムブラウジングとDNAモチーフ解析のための多目的ソフトウェア。BMC Biology。2010年、8:49 [1]

[MochiView_Website-2] MochiView ウェブサイト: メインページ 2010-08-13 にWayback Machineでアーカイブ

[MochiView_Features-3] 「MochiView ウェブサイト: 機能一覧」。2010 年 8 月 13 日時点のオリジナルよりアーカイブ。2010 年 5 月 12 日閲覧。

[MochiView_Videos-4] 「MochiView ウェブサイト: サンプルビデオ」。2010 年 8 月 13 日時点のオリジナルよりアーカイブ。2010 年 5 月 12 日閲覧。