このグループは、ムアンマル・カダフィ率いるリビア政府崩壊直後の2011年に設立され、リビア国内にも訓練キャンプを設置した。そして2013年9月、ラファにあるエジプト軍情報本部への自爆攻撃を犯行声明し、正式にその存在を公表した。その後、2017年までほぼ活動を休止していたが、イラク・レバント・イスラム国(ISIL)とそのシナイ半島支部との戦闘をちらつかせていた。同グループはアラビア半島のアルカイダとのつながりも主張しており、ガザ地区のハマスとも、ガザを拠点とするイスラム聖職者を通じてつながりがある。この聖職者は、シリアを拠点とするハヤト・タハリール・アル・シャームともつながりがあり、同組織は、2016年までアルカイダのシリアにおける公式支部であったジャブハト・アル・ヌスラの後継組織であるジャブハト・ファテフ・アル・シャームを含む5つのシリア反体制派グループの連合体である。また、ガザの聖職者を通じて、ジュンド・アル・イスラムとの関係を支援・維持しており、この聖職者は両者の仲介役を務めている。
同グループはアルカイダの一部であると主張し、アルカイダとその指導者アイマン・アル・ザワヒリへの公然たる支持を表明し、かつてのシリアの関連組織HTSと組織的なつながりがあり、イエメンの支部ともつながりがあると主張しているが、アルカイダはこのグループを認めておらず、関連組織としても支持もしていない。[ 2 ]
同グループは2011年2月に設立され、オサマ・ビンラディンの死亡後、同年5月に軍事力を誇示する形でグループとしての最初の行動を起こしたが、その後2013年まで活動を停止していた。
2013年9月9日、このグループは、エジプトのモハメド・モルシ前大統領が2013年7月に失脚してから数か月後、シナイ半島北部のラファ市にあるエジプト軍情報施設に対する大規模な二重自爆攻撃の犯行声明を出した。この攻撃により、兵士6人が死亡、17人が負傷した。アンサール・ベイト・アル・マクディスは、この攻撃に関する声明で、モルシ失脚後のエジプトによるイスラム主義者への取り締まりとイスラエルとの協力に対する報復として攻撃を称賛した。ジュンド・アル・イスラムも同様に、同様のレトリックを用いた声明を発表した。[ 3 ] [ 4 ] 2014年1月2日、マーク・デ・サリスとリン・ハウイーは、リビアのザウィヤ地区サブラタ近郊のビーチで昼食をとっていたところ、銃撃犯に射殺された。ジュンド・アル・イスラムは、このカップルが外国のスパイであるという理由で標的にされたとして、この攻撃の犯行声明を出した。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
2017年11月、このグループは再び姿を現し、イスラム国とその指導者アブ・バクル・アル・バグダディへの反対を表明した。ジュンド・アル・イスラムは、アブ・バクル・アル・バグダディとISは「ハワーリジュ派」であると主張し、またISのシナイ支部が地元のイスラム教徒住民に対して虐待を行い、ガザ地区を包囲したと主張している。[ 8 ]
2018年1月、ジュンド・アル・イスラムは、「ISILのシナイ州に所属するロシア人外国人戦闘員が、シナイのIS指導部との意見の相違が何度かあった後、ジュンド・アル・イスラムに寝返り、ISを批判するジュンド・アル・イスラムが公開したビデオに登場した」と主張した。[ 9 ] [ 10 ]
イスラム国のシナイ州は、2020年7月にアル・ブラス村でジュンド・アル・イスラムの残党を「殲滅した」と主張した。この交戦では、指導者「アブ・アイユーブ」を含む7人のメンバーが殺害された。[ 11 ]