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デイビッド・ウィリアム・ホールデン[ 1 ] FRS FMedSciはイギリスの微生物学者です。2012年から2019年まで、インペリアル・カレッジ・ロンドンのMRC分子細菌学・感染症センターの所長を務めました。ホールデンは2016年から2024年まで、インペリアル・カレッジ・ロンドンで英国初の感染症のレジウス教授に任命され、現在は感染症の名誉教授の称号を保持しています。[ 2 ]
ホールデンは1955年にニューカッスル・アポン・タインでブロンウェンとジョン・ホールデンの間に生まれた。15歳の時、一家はエディンバラに移り住み、そこでジョージ・ワトソンズ・カレッジで中等教育を修了した。1977年にダラム大学で理学士（優等学位）を取得し、 1981年にユニバーシティ・カレッジ・ロンドンで微生物学の博士号を取得した。カナダ、米国、国立医学研究所で博士研究員として研究した後、 1990年に王立大学院医学部（後にインペリアル・カレッジ・ロンドンに統合）に講師として着任し、1995年に分子微生物学の教授に昇進した。[ 3 ]
ホールデンは、混合集団における成長の変化を伴う変異体を識別するためのシグネチャータグ付き突然変異誘発（STM、変異体バーコーディングとも呼ばれる）を発明した[ 4 ] [ 5 ]。これは、固有の識別DNA配列タグ（バーコード）で標識された変異細胞の作成を伴うもので、これにより、多数の異なる変異体の運命を同時に追跡することが可能になる。この技術は、(a)固有のDNAバーコードを持つ変異体の生成、(b)それらを組み合わせて「入力」プールの作成、(c)プールの選択、(d)「出力」プールの収集、(e)「入力」プールと「出力」プールのバーコード存在量の比較による目的の変異体の識別を含む、その後の多重変異体スクリーニングの概念的基礎となっている。この手法とその派生技術（トランスポゾン挿入シーケンス、TnSeqなど）は、1995年以来、遺伝子研究において非常に広く普及している。遺伝子解析が可能なほぼすべての細菌性病原体、多くの真菌、寄生虫、そして哺乳類細胞において、CRISPRによる突然変異誘発と組み合わせて用いられることが多い。したがって、彼の発明はハイスループット機能遺伝学を変革した。バーコード技術に関する複数の特許が取得され、製薬会社にライセンス供与されている。
ホールデンのグループは、腸チフスのマウスモデルでサルモネラにSTMを初めて適用しました。[ 6 ]これにより、彼のチームは、哺乳類宿主におけるこの病原体の全身増殖に必要で、細胞内サルモネラ含有液胞（SCV ）から宿主細胞に病原性タンパク質を送り込むIII型分泌系（インジェクティソーム）をコードする病原性アイランドSPI-2を発見しました。[7] その後、彼のグループは、分泌系の組み立てと病原性タンパク質の転座[ 8 ]がどのように制御されているかを明らかにしました。彼のチームは、いくつかのSPI-2病原性タンパク質の生化学的機能を解明し[ 9 ] [ 10 ] 、そのうち2つがSCVを宿主細胞小器官に固定する分子レベルでの理解を提供し[ 11 ] [ 12 ]、もう1つがSCVの完全性を維持しながらファゴリソソームへの成熟を阻止することを示しました[ 13 ]。[ 14 ]彼のグループは、他のサルモネラタンパク質が自然免疫と獲得免疫の両方を阻害するプロセスを特徴づけた。 [ 15 ] SPI-2 T3SSの発見は、他の多くの研究グループにその機能を研究するよう促し、これらの進歩は、サルモネラの全身性病原性の生理学的基盤の理解をもたらした。
1997年、ホールデンはインペリアル・カレッジのスピンアウトワクチン会社であるマイクロサイエンスを共同設立し、同社は2005年にエマージェント・バイオソリューションズに買収された。ホールデンはサイエンス誌の査読編集委員会や、ヨーロッパのいくつかの研究所の科学諮問委員会に所属していた。彼は博士号や博士研究員レベルで数多くの科学者を育成し、その多くは産業界で非常に成功したキャリアを築いたり、世界中の大学や研究所で研究グループを率いる独立した科学者として活躍している。彼はEMBOのメンバーであり、欧州微生物学会、米国微生物学会、医学アカデミーのフェローである。ホールデンは2004年に王立協会のフェローに選ばれた。 [ 16 ] 2024年には、英国微生物学会賞メダルを受賞した。この賞は「その分野で世界的リーダーであり、微生物学の分野を超えて広範な影響を与えた個人」に贈られる。