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計算幾何学において、コーンアルゴリズムは、離散粒子から構成される物体の表面付近にある粒子を識別するためのアルゴリズムである。その応用分野には、計算表面科学や計算ナノ科学などがある。コーンアルゴリズムは、2005年にナノゴールドに関する論文で初めて記述された。
コーンアルゴリズムは、固体相や液体相を含む凝縮相のクラスターに対して有効です。1つの構成に複数のクラスターが含まれる場合や、クラスター内部に空隙が存在する場合にも対応できます。また、クラスターに繰り返し適用することで、複数の表面下層を特定することも可能です。